niuhuanhuan55
发表于 2016-7-15 11:57:14
ipsvirus
发表于 2016-7-15 15:21:07
质粒抽提后直接跑胶,情况很复杂。多数情况下你能看到三条带,但千万不要认为你看到的是超螺旋、线性和开环这三条带。碱法抽提得到质粒样品中不含线性 DNA,不信的话你用EcoRI来线性化质粒后再进行琼脂糖电泳,就会看到线性质粒DNA的位置与这三条带的位置不一样。其实这三条带以电泳速度的快慢而排序,分别是超螺旋、开环和复制中间体(即没有复制完全的两个质粒连在了一起)。如果你不小心在溶液II加入后过度振荡,会有第四条带,这条带泳动得较慢,远离这三条带,是20-100kb的大肠杆菌(Escherichia coli)基因组DNA的片断。非常偶然的是,有时候抽提到的质粒会有7-10条带,这是由于特殊的DNA序列导致了不同程度的超螺旋(超螺旋的圈数不同)所致。
所以看酶切图谱更准确。
你使用的酶虽然有两个酶切位点,但是酶切后一个片段太大,另一个又太小了,不好观察,建议使用其他酶,或者双酶切等。所以从你目前酶切结果来看,好像只有大提2是正确的。
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