包涵体表达小技巧之一:快速增值和收获包涵体
看到这么多厉害的技术,只能感慨自己落后了,写点常规基本技术充充门面吧。关于包涵体蛋白表达,菌种BL21(DE3),质粒PET41,双抗,内藏目标蛋白X。
牛牛菌种的获取:100ml LB液体培养基,加入2-5倍于常规的抗生素量,再1:50加入已经转入质粒的菌种,220 rpm 37度,转啊转,转法是,选择底部有凹凸的瓶子,或者把你的瓶子倾斜(水平夹角约70度),目的是保证转的过程中培养基溶解大量空气进去(有泡沫为证),我发誓,它们喜欢这个。当培养基的OD600达到0.5或略低于0.5(摇之前做好对照啊),收菌,做成含30%-50%甘油的储备菌,-80保存。这种菌,由于培养基抗生素含量高,所以都是“摔打”出来的,而且还处在对数期,为年轻一代,故称牛牛菌种。选一个无聊的上午接菌,晚饭前就有甘油菌了。
表达开始在一个慵懒的上午,早上8、9点,手持你的甘油菌快速解冻,1:100加到100ml 含有正常量抗生素的LB液体培养基中(不用超标加抗生素了),220 rpm 37度,注意还是要溶解很多空气进去,保证它们喜欢。
2个到2个半小时后,也就是11点左右,把你唤醒的菌种1:100接到你的大瓶培养基中(常规抗生素含量),此时你的牛牛菌依旧年轻奔放而活力四射,依旧220 rpm 37度,保证要有大量泡沫,然后你可以去吃饭和睡午觉了,当然,别忘了把诱导剂拿出来放在4度化冻。
2小时或2个半小时后,也就是1点到2点之间,你的菌液OD600已经可以达到了0.5-0.6了,此时加入诱导剂,比如IPTG,诱导3小时,依旧是快摇,保证有大量泡沫,哦,诱导时盖子要有缝隙,保证外界空气能进去。放心,有抗生素和优势菌在,外面的菌进去活不长。
5点到5点半,收菌,4度10000 G 离心10 min,弃上清得到沉淀。
此时你有几种选择,第一,把菌冻起来回家吃晚饭,一切明天再说;第二,吃完晚饭过来,不嫌麻烦的话用预冷的PBS重悬菌,再离心以去除某些杂质(反正我是不做这一步的);第三,把装菌的离心管扔到液氮里,再拿出来室温化冻,加入你用的裂解液(根据Novagen的建议),然后放到摇床上200 rpm 摇10 min,裂解液就可以把菌块全化了。
如果你迫不得已或者打算餐后做消食运动,可以进行菌液的裂解。要不然就留给明天吧。
在这里强烈推荐Novagen的BugBuster Mix,很好用,参照它的说明就可完成裂解。不足之处是贵了点。
Lysis A 裂解液配方:50 mM Tris.Cl,5 mM EDTA,150 mM NaCl,0.5% TritonX100,0.5%去氧胆酸钠,pH 8.0 (这个配方也许源于分子克隆,但是自己想当然配的,没看分子克隆)。
Lysis B 裂解液配方:50 mM Tris.Cl,150 mM NaCl,0.5% TritonX100,pH 8.0。
Lysis A 一般是1g湿菌加入10-20ml 裂解。
此时你有两个选择,第一,超声波破碎菌体(我从不玩机械破碎);第二,加入终浓度25-30 U/ml 的Benzonase和终浓度为1KU/ml 的rLysozyme,37度摇床30min。实际上,我经常画蛇添足地先超声再加酶摇。
4度16000 G 15 min,得到沉淀。
重悬沉淀用Lysis B,无论你想用涡旋还是吸管吹,都没问题,加多少LysisB 也没影响,只要能悬散就行,如果不放心,还可以加入rLysozyme或者Benzonase,浓度同上,室温或37度晃荡10min。
为何用Lysis B?嗯,如果你的下游实验是IMAC,大概不希望EDTA螯合你的柱子上的金属离子,而且,剔除作为阳离子去污剂的去氧胆酸钠也没什么坏处。当然,可以用无EDTA的蛋白酶抑制剂替代EDTA,然后不加去氧胆酸钠,那么你就只需要一种类似于BugBuster的裂解液了。当然,我不知道BugBuster的配方,也不想另加蛋白酶抑制剂。
用重悬后的沉淀可以10000 G离心10min后再用LysisB重悬,这个步骤可以做3次,然后用PBS重悬一次(PBS量可以大一点,以充分稀释TritonX100),16000 G 15 min,得到的就是包涵体了。
到这里可以冻上,也可以加进变性液变性,无论6M盐酸胍或8M尿素,带上0.2M磷酸盐或者参照分子克隆配方,但保证pH8.0为宜。感觉变性液吹不散包涵体的话,可以超声(大功率、间歇)打散包涵体,放心,三四百瓦特的功率打不碎蛋白,只会打烂核酸。你可以让它37度摇1小时到3小时,或者室温、4度之类过夜,有变性剂在,你的蛋白很安全。
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