包涵体表达小技巧之三:手工玩重折叠
先声明,关于这些技术,我数年来参考了很多方案,后来自己摸出了此步骤,如果有类似的方法已经见诸文献,纯属巧合,呵呵。手动步骤是无法使用机器的下策。
所有液体配方同机器纯化方案,但重折叠过程略作修改。
A液洗涤数次,直到你感觉行了,一般是3-5次,每次5倍柱体积,洗涤过程最好是4度摇床缓慢振荡,以不使柱子沉淀的强度为宜,每次2min足矣。每次洗了都要低速离心(1000 G 5min),弃上清。
设N个梯度,每个5倍柱体积,A:B体积比分别为:10/0,9/1,8/2......1/9,0/10。依次洗下来以使B液缓慢替代A液。每次洗同样是4度轻振荡2min,5倍柱体积,然后低速离心弃上清。最后还要用100%的B液洗两次,保证干净
关于pH值,与机器洗涤方法同样。
一些额外的建议:
一、以His标签为例,如果你感觉6x His标签会影响下游试验,那么分析你的蛋白序列,如果自带10个以上His,不妨在构建质粒时选没有标签的载体,一样可以很好结合,只是要保证手动洗涤时不会剧烈振荡。如果你担心蛋白自身的His结合柱子之后会影响重折叠,实际上要是带了His标签的蛋白也是无法保证结合柱子的都是标签的蛋白,而且根据我手上的FTIR结果,利用蛋白自身的His结合后得到的重折叠蛋白依旧是类似天然构象。
二、如果无法保证在4度完成重折叠和洗脱过程,那么就按原始方案保留A、B液和洗脱液中的甘油。不过透析液中最好不要有甘油。
三、透析之前,务必清楚自己的透析袋的MWCO值,别把目标蛋白透出去了。以上步骤得到的蛋白透析过程相对简单,加进100倍蛋白体积的透析液,4度透析1-3小时,再换100倍体积新透析液透析4小时或者过夜就行了。如果不放心里面的咪唑,还可以多透一两次。
强调:透析液最好不要是dd水,而是缓冲液。可以根据自己的下游实验自行设计透析液。但是最好不要带有下游实验反应缓冲液中不存在的成分。比如,你的下游试验如果是蛋白相互作用,而缓冲液不含钾离子,那么透析液也就不要含钾离子。
该方法同样适用于GST之类标签的需要重折叠的蛋白。透析后的蛋白若感觉浓度不够可以用超滤管浓缩,同样务必注意超滤管的MWCO......
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