[转移贴]吐血推荐：RNADraw-RNA二级结构分析软件
原贴由我容易吗我发表于 2007-11-25 14:06
RNAdraw是一个进行RNA二级结构计算的软件。
1.RNAdraw 是windows下的多文档窗口(multiple document interface)软件，允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。主窗口底部状态栏最左边的方框显示鼠标所在的菜单命令的提示信息，而右边三个方框提供了当前激活窗口内容的信息。
2.RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。 工具条上的两个按钮打开即时帮助（左边的按钮）或当前激活窗口的帮助（右边的按钮）
3.RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。用户定制RNA文库（Customize RNA Library）工具条/菜单选项可以让你打开一个窗口，使用右键菜单可以增加/移动/删除文库条目通过工具条上能量参数按钮或右键菜单计算前的选择项.右键能量参数菜单包括恢复/重新设置数值、保存/载入参数方案等功能。
4.在RNAdraw中可以导入以下格式的文件:
- DOS/UNIX文本文件可以导入到序列编辑窗口和序列信息编辑窗口。
- GenBank查找的结果文件可以导入到RNAdraw. 不同的组成内容会被放到相应字段中去。
- RNAfold结构计算输出文件可以当成新文件导入，也可以与现存的文件合并。这样就可以利用UNIX 强大的计算功能来计算，然后用RNAdraw来处理结果。
- Mfold关联Connect (.ct,.con ( GCG PlotFold -H ))文件可以当成新文件导入，也可以与现存的文件合并。这样就可以用M. Zukers不同版本的mfold程序来计算最佳的结构然后用RNAdraw来处理结果。
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