转化医学：利用体液筛查头颈部癌症可行(ZT)
本帖最后由 suki_sure 于 2015-6-28 08:34 编辑生物通报道
约翰•霍普金斯大学领导的研究小组近日在《Science Translational Medicine》杂志上发表文章，认为通过分析血液和唾液样本中的DNA来发现早期、晚期和复发的头颈部癌症是可行的。生物通 研究人员以90多名头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者为研究对象，检测了他们的血液和/或唾液样本，以寻找体细胞突变或人乳头瘤病毒（HPV）序列。对于同时提供血液和唾液样本的患者，他们在96%的病例中追踪到体液中的肿瘤标志物。
这项原理论证分析的结果表明，唾液可能是头颈部癌症中一个特别有用的肿瘤DNA来源，同时在寻找喉部、口咽部或下咽部的肿瘤时，血液样本中的循环肿瘤DNA往往能提供更多的信息。
约翰•霍普金斯大学的遗传学和耳鼻喉科研究人员Nishant Agrawal是这篇文章的通讯作者之一是。他认为：“根据这项研究，同时分析唾液和血液样本无疑是更好的选择。未来需要进一步研究，来确定在哪种情况下使用哪种体液。”
Agrawal及其同事相信，检测唾液和血液中肿瘤相关突变的能力最终能追踪治疗反应、监控复发，甚至开展初步筛查。无论是一般人群，还是高危人群，这种方法都适用。
尽管目前的研究致力于寻找已确诊肿瘤中存在的突变，但Agrawal指出，通过测序血液、唾液或替他体液中的DNA，以寻找与各种癌症相关联的基因突变，也有可能发现新的癌症病例。
“这项研究是鉴定原发性肿瘤中的HPV或体细胞突变，”他谈道。“但是，我们已经开发出一种集合，包括HPV、TP53及其他一些基因，这将覆盖95%的头颈部癌症。因此，没有必要对原发性肿瘤进行测序。”
头颈部鳞状细胞癌（HNSCC），是世界上第六大高发癌症。尽管这种疾病的手术治疗、放射疗法和化学疗法都有了明显的改善，但是，在过去20年中，这种疾病的总存活率并没有明显的提高。
研究小组指出，美国口腔疾病的发病率已呈下降趋势，这反映了吸烟的热度下降。不过，在同一时间内，来源于其他头颈部位置的HPV阳性肿瘤的发病率正在上升，特别是舌根处的肿瘤。
在这项研究中，研究人员着手研究是否能够从血液和唾液中获取这些肿瘤的DNA。这也是近期的研究热点。人们搜索并检查各种体液中的循环肿瘤DNA。
为了实现这一点，他们采集了93名HNSCC患者（其中73名是晚期患者）的肿瘤样本，搜索体细胞突变或HPV序列。在这项病例中，不到一半的肿瘤来自口腔，而34名患者有口咽部肿瘤。10名患者有喉部肿瘤，而3名患者的肿瘤来自下咽部。
Agrawal解释道，在HPV状态和靶向体细胞突变检测之间，追踪至少一种肿瘤特异性的标志物还是相对简单的。
只有5个病例需要低覆盖度的全基因组肿瘤测序。另外30个肿瘤包含HPV16序列，可以通过PCR轻松鉴定，还有58个肿瘤携带体细胞突变，可以通过对HNSCC相关基因（如TP53、NRAS和PIK3CA）的靶向测序而发现。
有了这些肿瘤标志物，研究人员就利用数字PCR来寻找所有患者唾液样本中的HPV序列，或利用另外一种称为Safe-Sequencing System（Safe-SeqS）的PCR方法来寻找肿瘤特异的体细胞突变。他们在76%的唾液样本中发现了肿瘤DNA。
相比之下，发现肿瘤DNA的血液样本的比例要略高一些。对于47名提供血浆的HNSCC患者，研究人员在87%的血液样本中发现了肿瘤DNA。
不过在综合考虑这47名患者的血液和唾液样本时，研究人员发现肿瘤DNA的比例上升到96%。
对于涉及到口腔肿瘤的所有46个病例，唾液样本提供了含有肿瘤标志物的DNA，不过对于其他部位的肿瘤，检测比例不足70%。对于来源于喉部、口咽部或下咽部的HNSCC肿瘤，血液似乎是更可靠的循环肿瘤DNA的来源。
Agrawal指出，这些结果可能反映了采集唾液样本所用的方法。不过，如果在采集唾液样本时要求人们漱口，而不仅仅是简单清洗一下，是否能够更好地检测其他部位的肿瘤呢？这还有待观察。Agrawal及其同事正在研究这一点，以便提高检测的灵敏度。
研究小组还计划在更大的群体中验证这种方法，以便进一步评估其性能，确定检测的适应症，并弄清可能引起假阳性的因素。例如，Agrawal表示，研究人员仍需要弄清楚健康人携带HPV可能对这种筛查方法有何影响，如果有的话。
页:
[1]