细胞培养反应器可简单地分为机械搅拌式生物反应器、气升式生物反应器、中空纤维生物反应器以及抛弃式的一次性生物反应器等。目前,超过70%的动物细胞反应器是机械搅拌式生物反应器,而且细胞培养的最大规模已经放大到25000升。机械搅拌式生物反应器主要由罐体、电机和电子控制器等部分组成。实验室研究用的台式反应器(Bench bioreactor),罐体一般是玻璃的,疫苗或者抗体等工业化应用的罐体则由是不锈钢制造的。搅拌由顶端或底部的电机来驱动,能获得良好的混合和传质效果。罐体顶端或侧面的在线传感器,连接着控制器,可以连续测定罐体培养液的温度、pH值、溶氧(dissolve oxygen,DO)等参数,并通过计算机程序实现在线检测和控制。对于几升的玻璃罐,可以用高压锅灭菌;对于几十升、上百升及上千升以上的不锈钢罐,一般采用在线清洗(clean in place,CIP)和原位灭菌(sterilization in place, SIP)装置实现反应器的清洗和灭菌。搅拌式生物反应器的主要优点是,结构相对简单,既可用于悬浮培养,也适用于微载体培养,细胞培养工艺放大相对容易,产品质量稳定,非常适合于工厂化生产生物制品。但其机械搅拌会产生一定剪切力,可能对细胞造成的损伤,不过在实践应用中可通过改变搅拌桨叶形状、细胞培养基的改进等措施来解决。此外,动物细胞培养反应器的大型化、自动化和精巧化也成为大家关注的问题。
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