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标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图 [打印本页]
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 08:52
标题: 如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图
来源:医学生学术
9 b, Z- ^( N$ }6 S4 R
您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
) k! Q$ @4 E: P5 o! C: J
小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
+ `0 I t! \7 K; S
——正式开始——
0 O Q1 H& y6 t" w1. 折线图
1 A- H/ [+ v3 g- {! B
折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
/ P$ x) H, _# ]
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
: A/ M9 x3 l y2 B: g! M
| |
0. | 0.942 | 0.846 | 0.691 | 0.515 |
4. | 0.717 | 0.836 | 0.653 | 0.483 |
24. | 0.408 | 0.367 | 0.342 | 0.231 |
| | | | |
1 J$ p4 r( a; P# }
打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
6 N1 k6 D% J7 d# I- A6 z+ M![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExFJZzP7frL4CL6Uws4cGM4I41EAuBhDvlPHtnwbpXyyhnGo8T8sCibcw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
& K: E; D" ]$ k/ K" r F0 A! S# l2 ~1 X% `' m# f6 T) ]9 o& K1 ^0 J
在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
7 C( F0 V$ V6 c# Z0 F2 Y0 {( z
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExhRRDUicmyZCKu9pftTxl4oJ0G1he8EicI9xtzw1HH0dbZ1CSlZoaPpicw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
% ]2 ?$ |* K, D5 L3 Q$ }
$ \# S+ u% c+ J% q4 i. r( q 软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
; g, H1 S W5 f( H, Q% l/ L
, {0 a3 E% `+ ]2 Q4 n, a4 v
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 u' B* K; T) F! B
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExBAiakpE7Wy46toUKVib2jvsQAExI9re3cehOaadVawz2IuLXKmsExHTA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
7 W2 G; l: r- b+ r % ~# T& x; h; l% Q
打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
- ^: \0 C/ G/ z0 B+ ~: _0 v) u
f) a/ T% J" ] T, ~& s" c
7 K/ W2 ]. I4 q _
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
7 j. R: R5 n- R
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExGTwv5H8CqxvMokNU2tHlfvzJNlEuVy0OqwrTvSSqKqWRXGwlAUaUHg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
/ _) ^) c/ M; j4 P+ t2 n2 f 5 M0 p2 N: d5 n% q4 n/ _! g$ @. z
在Data栏中输入数据
{4 N# w8 f/ b* Q" O
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExAYbTsHx6o5PFUQylWkVD9TOicMu7ALYQopic4sX7JGpHavgWfPE7MmGg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
D$ b: j2 `, L5 J/ C- k+ m; K4 {' s" q5 r8 z8 ^& A
软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
8 w$ D8 c1 K G8 O5 [( `
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExWJ4WQtCu5j2PbKP2vb2a0hgQ9Rxvz9sxFzzY71AKsg6HBVx4UH4SJQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
, w5 Q/ t" e1 x w8 t2 d 6 W) E, k+ P+ P* O
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
$ F, T+ c ]$ i8 a% W
如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
! M) Q' I# R# D; D( E
Table3
| |
| |
0. | 1.000 | 0.17 |
4. | 1.725 | 0.21 |
24. | 2.133 | 0.41 |
| | |
7 F. v- A2 N" e7 H新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
$ Q3 x; b. X" b4 Z0 F/ w7 b1 l9 ~* q
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExJu9ZSkuwfQcWPLwbWt4ia7LyicHPnEaAZt3bWAIAKMbRWCeSC0ZQeQibA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
- B: _7 S& o4 }" h % C0 L: B, [8 |# ?* H' D
在data栏中粘贴数据,如下图
s4 Z1 W5 A5 w/ y( f# ?
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExwgHrbdms2XEFNUDLrmicQNTtxO8hZakODbhoiafJnG9g6t673MAicUmCw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
% W$ V* b' A* i+ k9 G1 b ' t! a+ x1 B' m, w2 w
打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
, C/ n7 p1 a3 m4 h# f6 Q9 p6 Q! c5 n+ q; I4 N+ v; I9 c
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
, H+ ^- `) L# i( G 如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
, w x' R) j% N![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExVMeauJRm02IvkaMRUFnWib8YE4vZvkzdeDZ9Qr5s8fetkF18ibt2rqLA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
0 X9 b0 s y* y% V4 _! g ' g$ K L! }+ K6 l \8 l/ z
仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
% d: Q3 g" c4 _: t![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKEx8iaBD9icUxGvr5VFX1MvFeMoUTJsUCnCW62hIBZVcbOj2Mzhf4uBDRcw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
; l. E, b9 Z; [4 C+ @7 |5 T % z. }2 T2 @9 [' g0 Z$ b! v i$ }
将数据粘贴进去
, B- `4 T8 i$ w* ^2 e# D
7 N# K. l6 g* b3 l8 _4 c
* n( `1 e. E& y- m q- C& z2 L; I
软件即时生成的图如下图所示:
9 d. X, h( W7 u3 n- N![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExyMYJus9F9KoBRgOFprBL9UFxNYibZ8CLFE2SDH3q5ul3TGAictYCE7wQ/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
6 O( q I6 \! b# N1 a
- g* x$ L! W" W. ~! K
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
1 M! s& [9 y& f7 K2. 柱状图
3 |$ w/ n! a. }3 a
柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
% C, K1 G6 C4 X/ f: v2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
, d% b; i9 u+ H8 V6 c* v; m' w
Table 5
| Control A | |
Sample1 | 0.942 | 0.717 |
Sample2 | 0.846 | 0.836 |
Sample3 | 0.691 | 0.653 |
| | |
3 f( v4 ^5 i5 P6 y2 D5 i
选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
+ O5 D6 E7 [% G$ Z4 K( F1 o, U, C
- q0 u- M* u. `+ E
& \6 F. l6 t8 y. r* Y% Y3 h# M
在Data分栏中输入以下数据
0 l% s# g# O! n7 l![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExQY94JtEIUAFVHWZ5y1ut1muChNytHMJ4I0RK46qBTetlhksaWIAgLA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
; M$ @9 A: K6 v
3 ^3 F2 H0 {! @7 c! S+ Z g& E
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
4 I7 V6 A# K7 p& y! p* z! @
+ t$ n/ o0 t$ J2 M# t! h. g
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
& ^; r2 c6 f, Y( O
Table 6
| Group A | |
Control | 0.942 | 0.846 | 0.691 | 0.515 | , 0.717 | 0.836 | 0.653 | 0.483 |
| | | | | | | | |
) c7 D6 Y, D, x- ]* ^% W! _; X! N
这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
! g' i; l# q9 f/ t K
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKEx7ibWY5enzTLibVcn54JLMib96Nrf4lEwRSf4QmS2QgtdPUDlEpf2rVHSg/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
: ?2 j2 K' v& [/ I3 O. X- P: ^* e3 I# `! b
在Data分栏中输入以下数据
& `, i9 O: [; F1 x' o
![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExMjVoGYXLeAJHP6h1AjKRZcgaBWrZOsiaO4ricn93pSgyJPaHKLLyHryw/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
* w+ _ E1 g* m+ h+ y+ R; P! j/ a9 I9 \1 B1 M+ _+ Y
软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
# Q3 Z8 C0 ?) n6 [( f9 V% y) w5 t, m, C& }1 d, L
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
% `" f% S9 B, f! zTable 7
| | |
A | 1.000 | 0.17 |
B | 1.725 | 0.21 |
C | 2.133 | 0.41 |
| | |
& K# W5 a( c' |5 r
仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
) u& o% u2 d1 D0 G. M
- w+ H9 t5 ?8 `5 v
/ H' f( i- H0 L; r( A 软件及时生成柱状图,如下图
) n$ s& x% J' e4 A" F1 f
9 S) z' C* D. d0 b: K
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
0 q" m) \0 S# P% i- `- |* N用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
0 F- p; j' n0 v1 E, L9 L0 d
| Control | |
A | 1.000 | 0.17 | 3.604 | 0.31 |
B | 1.725 | 0.21 | 2.534 | 0.43 |
C | 2.133 | 0.41 | 3.381 | 0.74 |
| | | | |
' x! `0 w5 S, L; H6 n4 E) W7 D
操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
0 L2 D+ ^6 p! ~6 K
. L W8 T. x& ^7 y$ Y# I
3 e, E. J) a& w4 V% {& ^8 l4 m
在data栏中输入数据
5 h. P/ {: \6 M& M+ L$ o0 P
+ H9 W; A! R j) V" _" h
; ^5 c8 x U. W* D
软件即时生成的图如下图
* j5 N6 v1 i9 _& `+ S3 c: `" x: }![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExmLSibibMX7LpDFrJrxqdyrODulynTzymUhIBoE2mDFr0bBvkiaQQNuubA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
8 _) j8 A' D" G: a. L" G0 D. I5 s3 ?- z# `
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
' i$ M5 d. C! k" Z4 ]* U- x
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
7 e+ V& ~5 m6 l6 l4 ^' j( y
3. 组合和导出图片
' _' u. C) S9 x4 M* F1 b6 N
点击layout栏,出现下图所示界面
0 x) L! Y% M) s) M3 O# y$ h5 z, U' V/ z% q
6 K+ {8 S7 I* ~& M![](http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/Y7N3jSKFX2PHWfE1DvYPPRjWLVtUYKExr39UNn8x7RFnWBByIHlwyypZosyrS9l9yU4OiaRUb7lQlMZ2lia2jNtA/0?wx_fmt=jpeg&tp=webp&wxfrom=5)
* W; G; e- a \, s; a
0 T: |1 i4 t% L& N/ J 根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
" u: K) c1 x1 W, V7 c- R; Q, h
2 v( x1 ~; t i3 N9 z
g8 ^# m. Z5 Z
将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
4 ~' Y0 D6 f6 g3 c- `* S
6 k( ?8 k# _. h' \% S2 N3 R+ r
% C' e/ y) T" o' g$ x! ~
然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
- R8 n+ V2 l3 ^1 K# j0 g5 F' O0 x
; }5 B4 d$ L9 J' u. y2 _6 t
|- {% U1 H H$ S 点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
( b* Q; P$ Z7 H
! {/ B. `# u( A6 W# \
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 08:55
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。
作者: walkundersky 时间: 2015-5-13 09:12
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽
作者: 满清帝国 时间: 2015-5-13 09:25
( U6 L1 P7 s9 D+ Z1 U5 { a, C
刚好微信圈有这个,就转过来了。
作者: qupanke 时间: 2015-5-13 17:01
很棒的软件啊!表示喜欢!
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