微生物所多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组研究获进展

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12月17日，国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。
11月18日，华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章，在动物和住院患者中发现多粘菌素耐药的新基因mcr-1。该基因由质粒所携带，可以在不同菌株间进行水平转移。由于多粘菌素被认为是对抗多重耐药细菌的最后一道防线；此前仅报道过由基因突变导致的多粘菌素耐药，而这种耐药性是不会在细菌间进行传播的。因此，质粒携带的mcr-1基因一经发现，立即引起全球广泛关注。文章报道，mcr-1基因主要存在于中国，可能已传播至东南亚国家。

微生物所副研究员胡永飞等在mcr-1基因序列公布的第一时间，对其在目前所有已知的31000多个细菌基因组、4500多个元基因组、980万个人类肠道微生物基因（来自中国、美国和欧洲的1267个人体样本）中的分布和序列的差异进行了比较基因组分析。研究发现在368个已测序的中国人肠道样品中，3个人肠道细菌中含有mcr-1基因的完整序列，24个人含有mcr-1基因片段。此外，mcr-1基因存在于一株葡萄牙2011年从食品中分离的沙门氏菌中。这些结果表明mcr-1基因已经传播到中国健康人的肠道细菌中，并且早在2011年或之前已经在欧洲出现。比较基因组分析发现，mcr-1基因在不同菌株中处于不同的遗传背景中；表明除了质粒之外，很可能mcr-1基因本身连同其上游序列可以单独被其它可移动遗传元件所捕获并进行传播（如图）。

此外，文章特别强调由于mcr-1基因在鸡、猪等屠宰动物及零售肉类中被发现，该研究进一步证实其存在于健康人体肠道细菌中，这些数据强烈提示mcr-1基因可能通过食物链进行传播，全球范围应该即刻予以关注。（《柳叶刀感染性疾病》杂志在该研究发表的同时，报道了mcr-1基因已在泰国、老挝、法国、荷兰及阿尔及利亚发现）。

胡永飞为该文章第一作者，朱宝利为通讯作者。研究得到了国家“973”计划项目、国家自然科学基金项目及中国科学院青年创新促进会的资助。