一种可识别体内休眠HIV的新技术将极大推动艾滋病的治疗！

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基因组监管中心和庞裴法布拉大学的一组研究人员已经开发出一种新技术,揭示了艾滋病毒感染并提供艾滋病毒在人类基因组中表达景观的第一观。

进入受感染细胞的基因组后, 一小部分病毒进入休眠期,因此逃脱我们的免疫系统的检测。 这些病毒逃避治疗，始终是病人的一个威胁, 因为在稍后的时间,他们会自发地唤醒并重新启动侵染循环。 许多现有疗法和药物抱着清除潜在的病毒数量的希望，旨在激活潜在的HIV病毒。 不幸的是,这些疗法都没有证明能有效治愈感染病人。 在人类基因组中外源病毒DNA被宿主的染色质沉默，它是DNA和蛋白质包裹的混合物，将DNA凝聚形成染色体。


染色质沉默是由几种机制介导的，现在Guillaume Filion（基因组结构实验室组长）领导的一个研究小组已经开发出一种技术,旨在发现染色质沉默在HIV病毒对当前药物响应中的作用。


作为今天在《自然结构和分子生物学》上的报道，他们开发出一种技术成为B-HIVE, 允许他们绘制艾滋病毒插入人类基因组的情况以及测量它们的表达水平。“我们用基因标识符给大量的病毒设定了基因条码。 “利用该条码,我们能够将一个人的病毒与染色体位置联系起来” 这项研究的主要作者Filion解释说。 基因条码就像超市食品的条形码:所有的商品都贴上后,每个都可以由其特定代码来标识。我们也可以测量它们的表达水平，表明艾滋病毒对再活化疗法的反应在一定程度上取决于人类基因组中的完整位点。这些首次显示了染色质在抗击艾滋病中的实际意义”, 美国研究者描述道。


使用这种新技术,研究人员能够显示不同的艾滋病毒再激活药物从染色体内的不同位置激活艾滋病毒。 换句话说,这些药物比之前认为的更有选择性。 “有这种技术,我们现在可以寻找最好的药物组合,这些药物组合能再激活目前躲避任何抗逆转录病毒药物的所有潜在病毒，使它们容易受到破坏。“我们的研究显示研发互补靶点药物的未来前景”这项研究的第一作者Chen Heng-Chang说。“这是一大进步, 必将极大地推动艾滋病治疗研究以及我们对艾滋病病毒休眠状态（称为延迟）的理解,” 艾滋病毒研究者Andreas Meyerhans热情地补充道,他是该文章共同作者以及ICREA研究员。


艾滋病病毒表达的新的基因组地图解决了到目前为止仍未能解决的一个基本问题,它提供了洞察基因调控的基本原则。 希望它会成为对临床应用很感兴趣数据分析师的有利资源。 而激动人心的时刻似乎摆在研究人员面前, 社会作为一个整体如今都希望这个特殊的研究转化为对艾滋病感染者有用的实际战略。


来源：来宝网

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Position effects influence HIV latency reversal

Heng-Chang Chen, Javier P Martinez, Eduard Zorita, Andreas Meyerhans & Guillaume J Filion

The main obstacle to curing HIV is the presence of latent proviruses in the bodies of infected patients. The partial success of reactivation therapies suggests that the genomic context of integrated proviruses can interfere with treatment. Here we developed a method called Barcoded HIV ensembles (B-HIVE) to map the chromosomal locations of thousands of individual proviruses while tracking their transcriptional activities in an infected cell population. B-HIVE revealed that, in Jurkat cells, the expression of HIV is strongest close to endogenous enhancers. The insertion site also affects the response to latency-reversing agents, because we found that phytohemagglutinin and vorinostat reactivated proviruses inserted at distinct genomic locations. From these results, we propose that combinations of drugs targeting all areas of the genome will be most effective. Overall, our data suggest that the insertion context of HIV is a critical determinant of the viral response to reactivation therapies.

http://www.nature.com/nsmb/journ ... 328.html#affil-auth