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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

2 z# N* [3 ?! x5 w% x6 j& e& }# n
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

% N) b7 G# @& \
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

+ z% Y% d- e# q) y
——正式开始——

3 Z  u% V: x' ?0 G1 N# j8 c- @
1. 折线图
7 G& i+ C7 h9 C( B7 E! m; V
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
2 B. T7 I1 I1 a% T4 N
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

* w  }+ O9 Y9 y$ d
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
- O# I  F2 I* ^4 U+ H0 Y2 z0 E+ H
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

( s1 [+ J! r  ]9 L7 v6 K& ?  ?

6 A. O. v% v8 Q8 f4 |
. ?) y' b/ U: s( W
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
: b* Z5 k* [9 F, g" u

/ v. |" Y7 p9 A

2 ^6 R7 b) |* Y! r# B
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
2 P/ X4 v& M. U

8 H1 E3 _2 W# Y& s" n' }3 g
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
* @5 H3 u' \) f* f
" S( p8 J( V5 v, o5 y
3 o  _" F% ?. \  h% h
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
& r( V3 }& S( W$ A
; x9 R4 B: W$ ~$ j
: m5 Q. U# O, U  s1 w8 `0 G3 u2 u
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

2 o7 X" P3 l1 L$ p6 u6 d
/ P, Y- j+ s! l9 c$ a  y
* t' T& F' {' X$ }4 ]
  在Data栏中输入数据

4 j3 d$ F& `+ c2 d" B1 |
# |  M/ {. p6 k$ W$ a% [

) S5 S. d3 z7 Q8 H6 ~$ N
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
" s2 Z. s# w% h  e5 P/ z7 V
* r2 q7 |+ a- }, z( |$ G- A7 D

$ Y) M* J0 j& J% H, N! X
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
" q! `4 a) i- f
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
. G8 ~3 W9 l9 l% S1 e" y
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
$ v. Z0 F2 i& I. O( e! E4 f% R
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

/ [$ v" P9 T+ Q. r2 R' D( V. Z
* C) Y0 d0 J# X- \, X. T2 A
1 B$ M8 U% {( I+ R: t  [
在data栏中粘贴数据,如下图
. w0 M5 I$ N& @5 d4 M6 E4 I" [

0 S7 q' D2 {- V% P- |3 L, W
9 Z( k# l% Z1 i6 ^& s6 N0 u
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
! Y4 e( _1 c' K- D% I
9 s2 v% T6 c2 m
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

7 I: z- l* T, G2 b
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

2 A; _  V2 C! n9 K1 S
2 ^$ Z8 Y; J. \9 H4 C0 k! F0 y
! ~5 u' |, ^( |  p7 F# e/ h: [
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
: O2 P! ]9 q) B
7 I4 D4 A# x% p9 J/ ^- J5 p

. j5 h+ a$ X0 {* F& W# ?* S
  将数据粘贴进去

* B5 i6 I' z- n& Q

7 b- k' {5 Z6 L9 v; U, X% W- |3 i* Z
; j6 Y' F+ R; H/ z' ^$ i  p- S! J
  软件即时生成的图如下图所示:

, p, Z, _  e! I* F8 l9 c1 ^
( l" p! R% O% i: A$ W  K" `

. c- y1 v9 {3 Z$ q
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

6 T: ^; G# H  ~" P' S
2. 柱状图

& a( s( A  b% j* m( g0 S
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

- _- f. k- B# f0 I5 V
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

* J1 U4 m& n  L5 \$ E
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

' Z4 ]" |* F7 {& i4 [* q
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

- j. A5 F; r/ s% X  x
& D" Z1 _8 J6 p0 X2 c% Y# g) S; l# N6 u

5 J0 U0 O+ Q* K3 c) B: `3 a/ {
在Data分栏中输入以下数据
2 ]0 L, U, j, r% X; ^( i4 v

% b' c! V6 D& u$ o: V
, n! ~5 x' b; @8 K  {3 i; e! c2 K
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

9 G# T" T# [: N
* _5 T4 k6 o( k0 n  s9 b+ z+ F
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
5 G! ~! e7 i3 ?: ^
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

- J. t- y2 F( ]% ^- {& `, r
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

& }7 d6 d7 d0 `# Z. k
# e% E) u- ]( s

. D0 `3 W8 q$ C1 n
  在Data分栏中输入以下数据

1 }+ G( j* q1 d1 k0 L. b

' {( Z+ B* J: b
+ V- R( l: d" P9 i* C: g
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

' |+ R+ i6 K# Y  a$ m5 s

, f9 E( d8 L3 h4 [
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

: Q8 ^" \* ]/ e0 X$ ]" f
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
# E7 ~3 L9 k- X! x0 S6 C- W! J- z: f1 Y, }& P
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
5 p( ?' n5 b5 c  a

! _2 t( r8 {4 J; D) Y: I' k

) V1 h+ k% B& |8 K* b- `
  软件及时生成柱状图,如下图
/ z4 d8 w2 p* J& [1 ]

" ^' g, f* ?; i5 m, _9 [
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
. S- C' i( d0 v4 v( F/ w$ `- v
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
* T1 a2 j  P0 k1 H& c/ ]  A  Z
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

$ P4 Z, ~" |8 B& ?
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

% r% Y+ E: N+ i' C: y+ T8 X5 y. c
) X/ Q* a* W7 M- r1 E# P2 s7 p
4 R& q  r: f( L. W: m
在data栏中输入数据
+ G, J* v# V: b6 o6 r, S3 ~, K
  z# ^$ Y) O; U3 ?, e
) w$ H- i) G3 f0 f! `0 u
软件即时生成的图如下图
! p  _# h/ {& O! U! F' `$ Q5 i
9 f+ ~& p( [  j# S. o) P5 ]6 F5 H

. `  l( t9 E6 y: x  [
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

) C2 v- i; v1 ]  o$ U
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

$ e: j7 @& C" D3 {. m! Q
3. 组合和导出图片
# w- E; e1 i9 u
点击layout栏,出现下图所示界面
' b( A5 v6 f( ]1 \
/ [6 {# Z  G6 s$ [; D; Q7 _' s1 J
5 Z1 {- P) D4 n) ?# y, o

" @8 x* P% Q, X4 N
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
4 O1 d5 d# N2 I8 {" w

( a5 j$ @* O  x

0 u  W' F4 c1 M
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

2 \+ c1 g/ {6 B) p
. }: s8 w# n6 P& g" u% n% b

& S( G# R. t4 V$ A1 y  W
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

8 w+ h, s6 w( b' P7 ^& y
7 D, ~6 b& S6 |' J

( T5 P  ]4 u1 i7 r7 w
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

: t; }: a; P" c
, |/ I6 U, z, y1 @2 i
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论坛元老

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
- I( l# R' H1 z. b+ T" p$ T( x) q% e& U5 H% W7 f% ^% j' {

7 r2 b% h/ u. C比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
+ T* N" J) s5 Q3 c, x; \7 _满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
0 c) ]/ e' G( H. {3 S* R
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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