转移贴-A/Grganey/SanJiang/160/2006(H5N2)分离株HA基因克隆及序列...

rojjer

原帖由cloud发表于8/10/2009 11:58
刘熠楠 李晓冰 柴洪亮 张兰兰 张进 华育平.
来源：东北林业大学学报 2009年07期

    应用RT-PCR方法,对从一只野生白眉鸭(Anasquer quedula)中分离出的禽流感病毒分离株A/Gr-ganey/SanJiang/160/2006(H5N2)的HA基因进行了序列的克隆和测定。测序结果显示,克隆的HA基因全长为1731bp,共编码565个氨基酸。核苷酸和氨基酸的最大同源性比较结果表明,该毒株的HA基因与其它31株H5N2亚型禽流感病毒HA基因的同源性为71.0%～98.2%,氨基酸序列同源性为84.0%～98.2%;遗传进化关系表明,该毒株属于欧亚群系。通过血凝素裂解位点的氨基酸序列分析可知,该毒株的HA切割位点上未见到典型的高致病力毒株H5、H7所具有的一系列碱性氨基酸,符合低致病力禽流感毒株的分子特征。


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