Cell首次证实病毒组与疾病有关

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炎症性肠病被认为与肠道菌多样性降低有关。而华盛顿大学医学院的一项研究，将这种疾病与病毒多样性升高关联起来。

科学家们发现，炎症性肠病患者与健康人相比，消化系统中的病毒更加多样化，说明病毒可能在这种疾病中起到了一定的作用。这项研究发表在一月二十二日的Cell 杂志上。

直到最近人们才开始认识到微生物组（体内和体表的细菌及其基因）在疾病中的重要性。举例来说，肠道微生物组发生改变与肥胖症、糖尿病、代谢综合症和炎症性肠病有关。

病毒组（virome）是指人体内的病毒及其基因，这项研究首次将病毒组的变化与疾病关联起来。研究人员指出，人们可能忽略了病毒在肥胖症、糖尿病和常见炎症性肠病（克罗恩病和溃疡性结肠炎）中起到的作用。

科学家们应当像对待微生物组那样深入研究病毒组，文章的资深作者Herbert W. Virgin教授说。

“这只是冰山一角，”他说。“我们在这些患者中鉴定到的病毒DNA，很大一部分是人们不熟悉的，来自于新发现的病毒。我们还有大量的基础工作要做，包括测序这些病毒的遗传物质，理解它们与肠道、肠道菌的互作机制。”

Virgin等人分别研究了生活在芝加哥、波士顿和英国的三组克罗恩病或溃疡性结肠炎患者。将患者粪便里的病毒DNA与同一地区（有时甚至是同一个家庭）的健康人进行比较。

“炎症性肠病中提升的病毒多样性大多来自于噬菌体，这些病毒能感染细菌并整合到细菌遗传物质中，”Virgin说。

据Virgin推测，炎症性肠病可能使肠道菌死亡并释放出其中的噬菌体。也可能是有新噬菌体进入肠道，影响了消化系统或微生物组，进而引发疾病。当然这两种机制也可能共同存在。

要开发更好的炎症性肠病药物，科学家们需要进一步理解肠道微生物组、肠道病毒组与患者基因的互作。“人类基因和细菌基因都会影响炎症性肠病的发病风险，”Virgin说。“我们的研究显示，病毒组对肠道的潜在影响也应当被纳入考虑。”

目前，研究人员正在开发炎症性肠病的动物模型，以便明确人类、细菌和病毒基因对这种疾病的推动作用。

gadfly

是想说病毒引起疾病？

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gadfly 发表于 2015-2-12 14:47
是想说病毒引起疾病？

病毒组（virome）是指人体内的病毒及其基因

bigben446

【标题】：Disease-specific alterations in the enteric virome in inflammatory bowel disease
【作者】：Norman, J. M.; Handley, S. A.; Baldridge, M. T. (...)
【来源】：Cell, 2015, 160(3), 447-460
【摘要】：Decreases in the diversity of enteric bacterial populations are observed in patients with Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Less is known about the virome in these diseases. We show that the enteric virome is abnormal in CD and UC patients. In-depth analysis of preparations enriched for free virions in the intestine revealed that CD and UC were associated with a significant expansion of Caudovirales bacteriophages. The viromes of CD and UC patients were disease and cohort specific. Importantly, it did not appear that expansion and diversification of the enteric virome was secondary to changes in bacterial populations. These data support a model in which changes in the virome  may contribute to intestinal inflammation and bacterial dysbiosis. We conclude that the virome is a candidate for contributing to, or being a biomarker for, human inflammatory bowel disease and speculate that the enteric virome may play a role in other diseases.