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DH5α菌株特点的描述

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发表于 2016-8-27 20:31:08 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式

对E.coli基因型最全的描述在http://openwetware.org/wiki/E._coli_genotypes



F-,F 因子缺失


φ80dlacZΔM15,lacZDM15(Lactose)Map position:8 min


功能:lacZM15是表达β-半乳糖苷酶α片断的一段基因,当M15缺失(△M15)时,lacZ基因虽然能表达ω片断,但不能表达α片断,β-半乳糖苷酶没有活性。当带有lacZ(α片断)基因的lac操纵子通过载体DNA(如pUC19DNA)转化到lacZ△M15基因型的细胞 (如E.coli JM109)时,在有IPTG (异丙基-β-D-1-硫代半乳糖苷)存在的情况下,β-半乳糖苷酶表现出活性,它能分解X-gal(半乳糖类似物),使其呈现蓝色。因此可以通过平板上的蓝白菌落进行克隆体的鉴定。


Δ(lacZYA-argF)U169,deoR


功能:deoR是大肠杆菌中deo操纵子的调节基因,它表达的阻遏蛋白对deo操纵子具有重要的调控作用。deo 操纵子位于大肠杆菌基因图谱100 min 的位置,它含有deoA、deoB、deoC 和deoD等结构基因,分别表达DNA代谢所需的酶类,即胸腺嘧啶磷酸化酶、磷酸转位酶、脱氧核糖磷酸醛缩酶和嘌呤核苷磷酸化酶。deoR基因的变异,使deo操纵子的阻遏蛋白不能表达,宿主细胞合成大量的dCTP,可以选择性地改善大分子DNA的转化。


recA1,recA(Recombination)减少克隆DNA的非特异性重组


功能:recA基因表达ATP依赖型DNA重组酶,它在λ-噬菌体与基因组DNA的溶原重组时起作用,同时具有对DNA放射性损伤的修复功能。由recA基因的变异所产生的基因型使同源或异源DNA的重组不能进行,保持插入DNA的稳定性,对DNA的转化有利。一个菌株的基因型如果是recA,则说明此菌株的表现型是重组缺陷的。


endA1,endA(Endonuclease)无Endonuclease I酶活性,有利于质粒的纯化


功能:endA基因表达非特异性核酸内切酶I,它能使所有DNA双链解开,在DNA的复制和重组中起重要作用。endA基因的变异将使插入的外源DNA更加稳定,提取的质粒纯度更高。


hsdR17(rk-,mk+),限制缺陷,修饰正常可使DNA甲基化,但不限制外源DNA


hsdR (Host specificity defective)


功能:hsdR基因表达I型限制酶EcoK(K12株)或EcoB(B株),在大肠杆菌细胞中起到一种“抗体”的作用,对外来的各种DNA有严格的限制。HsdR基因的变异导致菌株细胞内的I 型限制酶EcoK或EcoB活性缺失,这对于外来基因的导入及质粒转化是有利的。hsdS20(rB-、mB-),其中S20代表特异性识别蛋白发生变异,()中的 rB-、mB-表示由于S20的变异而导致B株来源的hsdR和hsdM的功能缺失。


phoA,supE44,supE (Suppressor)


功能:supE基因表达的阻遏蛋白与停止密码子UAG结合,使蛋白质合成停止。supE基因发生变异时,不能表达正常的阻遏蛋白,即使遇到停止密码子UAG,蛋白质合成仍能继续,并使UAG作为一个密码子来编码谷氨酰胺(Glutamine),从而使发生了琥珀突变(AAG→UAG)的基因对蛋白质表达得以延续,因此称supE为琥珀突变抑制因子。supE44(sup基因座E的44位突变)。如果不知道几个等位基因中哪一/几个发生了功能性突变,则用连字符“-”代替大写字母,如trp-31。


λ-,thi-1


功能:thi基因包含有thiA、thiB、thiC、thiD、thiK、thiL等。thiA表达硫氨素噻唑转运蛋白、thiB表达硫氨素磷酸盐焦磷酸化酶、thiC表达硫氨素嘧啶转运蛋白、thiD表达磷酸甲基化嘧啶激酶、thiK表达硫氨素激酶、thiL表达硫氨素甲磷酸激酶。thi的变异使硫氨素的生物合成不能进行,最小培养基中必须添加硫氨素(VB1),细胞才能正常生长。硫胺素代谢突变在基本培养基上的生长需硫胺素的存在。


gyrA96,gyrA(Gyrase)


功能:gyrA基因表达DNA促旋酶A亚基。DNA促旋酶在DNA复制时具有使DNA解旋和回旋的作用。萘啶酮酸 (Nalidixic acid)、4-喹啉(4-Quinoline)等抗生素抑制DNA促旋酶的活性是通过与促旋酶复合体(A2B2)中的A亚基的结合实现的。gyrA基因的变异使DNA促旋酶A亚基不能正常表达,萘啶酮酸和荧光喹啉等失去结合目标,从而使该基因型的菌株具有了对萘啶酮酸(Nalr)和荧光喹啉的抗性。


relA1 relA(Relaxed)


功能:relA是松弛调节基因(还记得“魔斑”吗),对RNA的合成具有调节抑制作用。同时relA基因还表达ATP:GTP3'-焦磷酸转移酶,负责在氨基酸饥饿状态下鸟苷3',5'-二磷酸 (ppGpp)的合成,以适应饥饿环境。relA基因的变异对目的基因的转录有利。

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沙发
发表于 2016-8-28 22:36:09 | 只看该作者
受教了
好好学习,天天向上!
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