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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
- M3 u0 L$ e1 \/ _$ x
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

* B& l& S  [4 N& Y5 s# e% n
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
0 J4 u; O' ^0 e! F" A7 l& F
——正式开始——
5 Z3 C$ N) i& S; K# @9 z
1. 折线图
" y# i0 m. b  r6 z2 g
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

/ @4 Q0 R+ Z1 R9 M9 Z
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

. o! Y! |# U2 S5 Z/ G: a0 ^
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
9 [$ k$ T2 u) p# S# T  B
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

) F8 @+ a% Y7 Q, M

/ B0 V  E) v1 b4 W

! T5 `! J" ^) u. g) s3 d+ l
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
" ^" G7 O( e( S- D4 n
7 U. f% @/ W" s' ^6 y' V. X

$ e5 E9 O( y/ e% s( P' }# {" o
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
) z7 v* y, P9 ~
+ b1 u4 h3 T6 h/ m& k# i
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

# n) k% E3 _' G/ I4 e0 |* k! i+ Q0 U1 _
& X3 C# P8 l: Z; r; w6 {

% B. W9 e0 x  R$ O# z7 L1 c2 Z* u
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

9 G# M& ~% v- d: n8 p2 ~

: [' L6 B- x, ]8 L. R1 ^

" a2 S9 ?) ?3 Z! n( }
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
' Y0 k# w3 T' e. |: B/ d) B

4 W* d- B( v" t% ?  M5 j
8 g, E* L6 g/ q) `  Q& f* ^
  在Data栏中输入数据

- ?) l+ j6 D: o6 U) n% ?2 b
, l+ \% ~+ q! ^  m5 [: ^2 L; Q

  N& d# `# D) P5 n4 z! k2 H) Z, D
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

; x+ u* E% Q4 s9 `) P( j4 h2 U
: r6 [: `( j. g) k4 w

/ f3 Z* ~0 ]) A/ W
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
! A1 i7 F+ q9 Q( i
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
+ @2 Y9 {3 ^0 H
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
2 x. t) X$ S$ c2 j
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

( X( Y" z3 r- w- e3 b4 p0 m

/ L2 x0 \; p+ [  {! S5 o4 Z0 `
2 d: R% i6 j+ t4 X; D1 m
在data栏中粘贴数据,如下图

  S0 B1 V1 w3 W! ]* a5 t, |

+ S5 ]; _7 f' G' W) ^. D2 g8 m$ C% o) N

1 M; ?! i2 o- \4 o  E( l' e" W
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

9 {* C$ G" @0 j# p
1 F/ ~* n2 n3 @+ R1 `" ]
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

6 k# |- Q3 S# X) y
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

. f$ E' {& ^+ u1 L" T- H
* y( p9 X: L# ?. V% u3 D. ]

2 O  R7 d& A  \- ]9 n2 x
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

0 m  V" F$ j: R2 I* R) o
) L$ |' d, `( t' k  Y
6 s" ]7 Y. L7 D3 W9 b; ~
  将数据粘贴进去
6 ?. ?) U$ T5 n$ e, K( D
* B3 _& \4 c" P7 y( F

* E% X( C; {2 P
  软件即时生成的图如下图所示:
% B& ~- h' Z/ V6 v* i3 u. o) v
0 D# w0 h& t& D$ }1 X$ s7 K: J, ]

0 W  t1 r4 J1 Y, @7 @& v
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
0 o+ }% j* F! z$ o2 [8 y/ o
2. 柱状图

1 B- B$ v; C- }
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

/ V2 H2 c& _  y2 P
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

. G1 J- G3 z& D) |0 `3 O1 c8 |2 w) m
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

6 R0 h5 R: `' E& l% y$ m; h9 r# e5 f
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

$ N3 T( d5 u8 S% J3 n. X

( f, O! P  K1 M" i2 [

6 a; V' V$ a! y
在Data分栏中输入以下数据
; g0 R0 }1 m4 r9 G

7 v* N. x1 j; B5 T2 _" Y- `7 ^

( c+ h. S3 T- D2 V& e( _' r
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

0 D( g' b, d& _: H
' ?' e3 M% F/ |9 |/ U
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

0 K$ p6 ~1 x; k  s
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

* H7 C% G# Z' |
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

5 Y# u, N% \4 b1 h* F/ \0 z
. j' U0 q9 z. ], r0 ]

, D" ~5 N0 q" E3 ], M( N) W4 d
  在Data分栏中输入以下数据
. P6 H5 L; p+ O) [" r$ _

$ L" K2 ~' f: b6 [

6 J+ @- x& T( n8 L) n; \
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

3 O; ~" p/ }2 i; [5 ~# P

; f4 p9 H. Y: z4 s' t
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

% l/ D! ^+ y) x
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
- M3 _3 d* k% `+ N, _
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
1 d1 f/ g) ~3 ]

: Q1 n& p% r4 R6 d+ M
% f+ ?8 w$ S' n6 {; }. f* U
  软件及时生成柱状图,如下图

2 v1 w$ ~& O7 ?- i8 }% G

0 H, \  A, f( T0 w: y* [) `, y
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
8 `8 b+ O$ J0 \
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
) ~4 @& h4 p' c# L$ g9 _
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

. \. V' t; ]  N1 g) b9 V) W) i/ D
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
( l! f2 U9 ^# ^  S) r, ~/ _. l# j

1 B6 A% B5 }& B+ H" E

  E+ Q. C  ]5 N8 |! \
在data栏中输入数据

0 a$ |2 K! W7 R# b4 Y
3 b9 O/ Q2 M8 b5 ?+ k
! `  ^* H/ V& ~9 l/ l+ Z
软件即时生成的图如下图
$ T! V! ^& d: N- T$ x  q0 L0 w" X/ N
* X& r/ M1 ?3 h# i- m

. n* h7 K" A. U5 S4 R
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

0 a: n. E& b9 _1 L3 k0 B: H6 j
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
3 P7 R2 S4 r- d2 u
3. 组合和导出图片

9 f# ?6 {/ J7 n6 \9 `. x8 k" H
点击layout栏,出现下图所示界面
1 L% s3 h; I  A0 ~9 j7 P1 \" g

4 F. \0 k1 r$ `
5 r' S: J+ A2 j# E0 m) y
( k2 s4 a2 Z* d  w% t
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
. a% T1 P% G! s, S4 z: ~8 G

3 [( H5 F' q, Q4 m; p
0 O& v1 ^* A* I2 ~
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

# f: {' h2 b4 u, w- S

( l5 I" u: W2 }& ]6 ]! ?

, ^# V8 q: D5 k% m& k; v, P
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

4 W2 I& M8 {. S2 v5 K% [
# n4 V3 @% i, x6 H

. ?, C' K6 R) W. Q$ W% x' c! `$ q
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
! {# N) _6 F) i( n, ^) ~

2 n1 G6 h. A6 h! z$ p; b1 |
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) r. }# x! z# ^! ?2 G! S2 u. \) W2 ^7 }' F
7 @  e( K# _& U5 E6 X5 Z
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
2 p2 {: e/ Q3 m2 x满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

7 F& b3 N2 E9 ^5 m3 e刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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