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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 显示全部楼层 |阅读模式
来源:医学生学术
; X# x( M( t: t$ V
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

: o, E( R# D2 P5 o; H5 q/ p2 w
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

/ c: v  j8 D+ j. o
——正式开始——
* H% e% M, v& I: {' T; l6 A- y0 f
1. 折线图
, w5 \! |; e/ W1 S5 _$ W! K. T3 Y
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

( \8 f- g( O6 V8 N, N* }' \
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 ?% o5 M0 T7 p: M
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

0 B4 p) K, z6 g
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
2 f2 ^7 }, W. G; c4 y5 \

) s% ]+ G4 I$ k* U7 ~6 u+ Y
; s' H; g, L! w4 }! [! A
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
! ~0 M+ x" W! F2 f1 h

$ f' E4 n8 s4 j* u

0 w3 }7 K. j+ Y' a- B. J* I& |/ j
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

: O( h! I% E4 H6 W$ X& Z( z

0 t2 v: z8 K7 |# O5 i
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

! a. y- i* n4 K6 Q
; J) A: [' M9 a

, T- ~8 ]9 M# Q  Q! E
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

+ |" [2 W8 D- D
5 b7 e& r6 I  k* Q
0 s  G+ H# |  e: U
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
  Z' Y; J( N5 y; v4 _* Q0 e/ d; X8 e

- H- Y3 O3 f& }0 g, k% ~0 q4 g
! e* W7 R( W  ~! g. V3 B" c- B, p
  在Data栏中输入数据
/ [- }0 f7 ~0 [$ f) ]/ B3 w

, O4 t8 ~) Q6 V3 A2 A" V9 f

6 y# |1 ?# F, F  o" R+ O2 f
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
0 U4 A6 S. f4 P" b
. c6 H5 f. R1 R  Z9 _$ a

- }9 w! d0 e6 ~, }& U
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
9 X& S9 J- U: J4 ~, K7 i  c1 D* i
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
$ B) T! D3 }3 x! Y2 \& }7 M
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
' o5 a- \# t/ _* Q  I: j
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
- m: s7 L% S+ a& r! I/ T

; A' e9 K2 B$ l# w8 _) c

; C% C# j7 I4 j# G( a$ @: Y
在data栏中粘贴数据,如下图

4 G& p6 V, ]. S
" M' X' X9 A6 K6 n8 M
; |9 w8 U' X. O! d  L
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

( I! v3 D& i4 i4 w% b, |, P0 z
1 K1 @; S( k9 v9 s& ]8 l
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
& |6 a# }' O. q; q; Z% b& q
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
: Y4 _8 {4 e0 i; \
( p( m  p$ {2 B2 U8 k

1 `0 Z0 {  ?7 K$ u, R* `( i1 L% u
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

3 o1 v+ e. W, h# g  U5 c( ?
" k) S9 ^; A' r) e1 p
5 u1 N1 M# q: j8 f- P* `/ Q
  将数据粘贴进去
0 T) I" T' @1 m; U( |  W2 S
+ D$ r2 ?: P' A& U1 H* W) w7 i

4 S/ E5 a3 k0 i+ j4 b# o
  软件即时生成的图如下图所示:

: l6 A% A! P+ E5 y% X9 [) Y% y- l

0 C* B% G: C% s

+ Y5 P# P: o. @' a+ G6 J
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

# N+ {5 k2 s4 [/ ^
2. 柱状图

+ e; n  l9 n) D  f8 ^* G. G3 c
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

' n9 `6 h! K: {, c! W
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

4 Y1 M7 G, S7 K+ P  L6 H5 N" B) g
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
5 {' z4 n4 J. `7 c. F
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

" w/ [, O" X( T# G9 L

4 j4 q! r& g+ Q2 B2 p

. ^( Y& N3 B7 r. [  o
在Data分栏中输入以下数据

# A1 o8 j/ E8 C  h3 o9 a
- k8 o% D1 ]7 D6 @

2 Y% \! s, y/ L( ^3 C
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

# G# t5 \( n2 m

8 _* r7 H; }5 q9 Y8 w* c
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

. K; A" i2 l+ p5 w
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
6 P% H$ a% B3 n- D) ~+ s# n: ?
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

7 K  ~" H; t; |, p0 b; ~+ T& T

+ H) D! @2 V8 S4 l. C0 E( x

/ p6 N# ]/ P1 Z" [% @9 [9 R
  在Data分栏中输入以下数据
5 \: R9 W) }+ G4 H7 ]5 T+ @' E
8 v- G* J3 G( N8 @9 `2 U# n. }

9 C+ k" E! ~$ m6 q) i$ V
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
( R6 Q) Y+ N! h5 m

" Q. ~" Y0 p5 G8 W2 l8 j" h
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

, `, S: V/ V- L9 v, u: l$ q  ?
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

1 d6 k+ m! P7 J8 O
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

0 G: J" T* v) t  B+ C* E: t
3 B6 g! r6 C' ?! B
$ h, A; P; i; V7 S7 T
  软件及时生成柱状图,如下图

8 G: Z0 U6 |3 j5 o) a

$ ~' L) U3 W/ F( j7 R/ }' l
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

' c4 F  M2 W, _2 V) }" x
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

# r/ S4 E1 j+ I, e
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
$ n. Q1 P% M2 o' o* x" a
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

4 D7 p6 x3 @/ i/ w  O/ o: Y- |
' g" t" q- H0 q
  d4 ~. A/ V! ^! F! T5 Q, {
在data栏中输入数据

' `% k& ]7 ?+ a6 O6 D

) F3 k, {5 ?( b" a  d

: }' q( I  Y5 g& [( i
软件即时生成的图如下图

6 \2 ?* J# T9 o8 I7 W

: \! q1 [5 _2 v! s" h' k; K

. h/ V. ?) e; u+ @3 s, A
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
2 u1 T  C9 i4 L. D8 z
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
( \, H) I& w( |8 J- K6 }
3. 组合和导出图片
2 F6 o* r) [' I' G6 H% ?
点击layout栏,出现下图所示界面

' x  f  Q) T9 k7 Q- Q, r

3 }8 X. X. _6 F3 R, f5 l
, R' ~3 x  o, A( P  Q

) U5 a/ n/ b2 M- w  }9 x5 T( |
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

; Q. a8 r7 K. C. E7 ~/ H; \
# I; C& [# n! y+ {

% f! J! f3 _" q* ~
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

% X; t$ B* v" L6 {5 t8 V* f

% I! p+ [" U- M8 h

: U2 U6 X3 I0 k8 C1 f
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

6 W  p( x+ r2 x7 t# R  y8 Z1 y, F

3 M- x2 u" O' ]* V

& d4 i1 g3 k8 h& g
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

9 x; |$ d9 l. V
% U. @9 q/ K+ c# ?! ~( N

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 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 显示全部楼层
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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发表于 2015-5-13 09:12:24 | 显示全部楼层
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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 显示全部楼层
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:127 i! C1 [; C3 f4 ]
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
* g; z* Y+ r* `$ x0 j# I6 s# |
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 显示全部楼层
很棒的软件啊!表示喜欢!
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