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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
/ w9 Q) f0 ~4 O2 o
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

' M5 \; O5 Z+ [1 i
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

  I# w: n% N! Y9 I) e* C
——正式开始——

) O. @3 @' T- x; G/ i; r
1. 折线图

$ w/ S' g9 ^6 y4 E2 q
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
! o! x) O1 N6 A$ A" X" a3 X' |7 Q
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

7 _$ L( Z3 J0 O6 I, |# p1 d
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

9 D7 c& j7 \6 _/ z/ C, x% B( i
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
  X, s% u3 @$ i, o) c; G
$ u. M# \$ n, d8 ?0 E

0 D/ d& R1 R4 K: u1 @% V
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

5 G* n$ I! y* p! z2 x, v% p

$ A  W+ `- o/ z
( \4 Y( Q+ g  i$ i" j! C6 @
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

5 x  C5 @3 u8 I" D' v6 z
9 h, e" @  {/ \0 \. F* @+ z
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

% E, V) x2 l6 ]0 D

, k3 H+ e% F: V# c2 t
. C" }/ i9 b( g$ a$ Z3 @/ m
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

* N: B8 U$ m. I( J5 ~
) T9 {4 O3 F5 u0 ^9 V4 ?

$ i: l0 S5 A/ t/ r
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
, d' x/ S9 W3 ^. {5 R

  r/ U  |  C4 W& L+ c

8 A% z! R$ c- F, w: [1 d, m5 D0 Z
  在Data栏中输入数据

# b$ q/ q5 j5 q' L1 ~. {- n
% t: ~  i" `# t" h, m" R

' x# ~  t' k7 i4 a3 K
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

7 j( `: S/ t3 P
$ h7 |9 x- F# q  k  R8 k# M8 ^

: A5 _! z5 m/ Q0 T7 B* h- z: t
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
- H8 q: Q7 J! E2 a1 n. F7 B$ O
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

/ L& ~  O  R* `* v* ^# V
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

, J2 r2 u$ q' G6 y1 L7 |5 z
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
, }4 k/ c" v8 d4 r6 ?
3 B+ e* Y  j7 K
. c. x1 N: w; w: M, \
在data栏中粘贴数据,如下图
. P- u6 L2 r0 n9 k# K, U

( E, o3 p0 O4 d( H0 q

" ?, \& A6 {1 T
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

( p2 q- q7 e# t: E: v) T9 M
7 m/ |- ]1 @1 h( J! T
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
1 T4 j7 o5 s2 M, {
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
- ^  A! C5 e2 F8 c# @1 _
4 g. w' \' V4 C8 _. [' i4 F

( {0 a; C6 g8 n4 F1 E/ F/ U2 ?
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
' H0 g/ A1 ~' [6 J! T& l
& v- _& K% y$ G  `. y2 U  t% m
1 ?; G* o0 g- o7 W6 s  ?7 ?$ q
  将数据粘贴进去
9 H8 A, J" j; i$ J0 \, _
* ?6 L/ Y: P3 z
% B$ c$ B/ X9 K, ?
  软件即时生成的图如下图所示:

8 W' i/ ]. D- H8 _; ~9 j. V+ j8 X

9 X) F7 _" b- I% [) x( h

8 g" Q, s# d3 D; H8 t
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
$ G" [% a/ b6 V, n1 W8 _8 \1 i% Q
2. 柱状图

/ D, j- J+ ]! K4 ^5 u4 n
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

$ j9 m  V( T# t+ f0 M# i, {: u
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

- H7 m& r& `3 c* V
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
5 x5 X$ X: s' S: y( E6 g
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

' Z) V: ]( v/ I  D

+ Z5 a: ^! d  [3 x% ]- _

$ ?- ~& t8 B1 s2 e8 }
在Data分栏中输入以下数据
6 B+ M7 Q7 X  P( |) ~3 M8 {# B
* f* c' l2 K9 `3 R

. m. d; j" B1 g. G, Q
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
5 Q# |! L8 @+ C3 m
" i7 q6 H5 J5 Z' A% H9 Q! T8 Z
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

( V! L( s  \9 b5 `) _! U1 \
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

( ~! z# ]5 ]5 t. _4 ~& p- n" x+ A
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
8 M/ z1 B  a2 {8 U

* A; R/ w" @0 o% E9 |
) U- o8 n5 d9 {9 H, T2 D- `
  在Data分栏中输入以下数据

7 w$ Z, _2 N. G8 Q3 M

" l; o; C" {: z9 L: X9 H
+ N, k& {( o' F2 K5 Y& Y8 _
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
* |0 b7 ]7 ~9 v; \8 I2 @5 x3 F( _
+ k! z/ ~: N+ j* b; D' j
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

+ y, ?- Y  g) O# R) v# @
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
& U+ a4 h5 d. p0 K& `! Z) p
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

0 H! E. Y* H  e( d; b7 |5 U: a
4 w& Q3 u2 S; ^4 K1 l

8 \- {: N0 A4 N$ G& z
  软件及时生成柱状图,如下图
. [1 X# o/ P8 K- d" a$ G  N( {
0 K& b: D$ q* h. X- I& F  `
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
1 [7 y7 C3 D/ O8 A% }% G) x% e
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

+ L  ^! |6 j& n8 y4 p4 t+ L
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

6 H- W) ?9 B7 m: u. \. ^8 {
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

9 S) r( I' o' }& ~5 y( _. l

$ l0 n4 e1 C# e/ Z5 }
# D( z& q, U- ~, y
在data栏中输入数据

( f8 E" ^' {; a7 X, y
; e, ^* l8 A( \. M  T+ c

" M# j7 g1 q# L7 G, j2 i. r. D  E  `, m* c
软件即时生成的图如下图

. S) M% T  W% F+ T* ^6 v3 R$ P+ j
: Z1 x+ K- H" J: ~

6 O* k% k' g1 B
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

, U% f! d* x  a( a) ?8 y7 O. p
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

% c7 J9 ^9 i  {3 m
3. 组合和导出图片
- }! U, b/ T8 e, Y. z
点击layout栏,出现下图所示界面
9 D0 l! u( @. q3 s$ e4 ~

0 r% Z" n2 d5 K& e  B% Y8 H6 ?

/ U' Y2 R2 o/ e7 B8 {* v
, F5 f9 I9 f7 J
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
8 r& m. r% t" A" e" h( O

+ v/ r) h* g) ]# @! m
. C. q5 v& Q' H1 k$ ~* o( ?
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

# V% A( _# i6 W  k# m7 v

8 f+ C0 j- M! w3 N1 N  e

; B: W# D  F: \6 l, A
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

( Z" @5 ]$ H9 ?2 P! f& v5 H2 ]) X# e
% L" ^. |/ I# F" h2 N

4 T. C) h& G& m# c! t
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

! X) j* f! X2 Y, j+ p2 D2 ~

) l: D# B4 u4 ]; L- ~
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
" l) p" N1 Z+ q4 s" D
7 N% k1 a5 u3 O8 Y* ^+ f" s
3 ^% L0 w7 w* O$ q比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12' i& j; m- I& B: n+ Y  l
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
8 a4 p/ H% H4 u7 Z: f
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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