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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

" ?$ Q2 T+ A9 V
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
0 h* b9 Z% |% O% v6 f9 L1 u
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
. A, b1 C1 K1 \# g; O6 x
——正式开始——
9 P. F3 V' [3 U( C
1. 折线图
7 r7 K. V% D( r$ |. p4 V. L
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
7 `+ }  W  M8 z' D
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

7 |8 s% ?4 h' X
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
5 K5 ?/ ]' h# k* F" v& a# V/ Z/ m- C
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
$ Y$ c; P4 J& v  X. M7 |3 T

: O1 ^+ ~1 q* }2 m8 `  W: L% M; N
3 T: X, i1 h1 O  Y
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

0 \6 |7 {  M# l) {! o  _- b

- H3 @5 X3 ^2 q2 s0 e: H6 S% J6 b

/ M, |7 j" a* O/ B( M$ f
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
. ?* ~) ~* I& \  A# m
* f' w) t  p* t
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

& Q6 |: e# X/ y% B9 P; Q
) i3 d, y% H& k  ^& p; G2 h

& g# P' J6 |# d" F" T! h
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
' k2 {5 j" j  `+ R- [

/ w: H6 r1 p  Y+ k- C7 X
6 ~! O0 a: c4 i
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
$ j/ V5 s1 H1 i3 U6 g4 S9 J5 t. k- n

9 N* R2 ^" C7 R" X' w
5 p+ f, k; G4 i. ^* U1 ~8 i
  在Data栏中输入数据

, W4 b: n* ]1 i. I& c( I8 M
- _6 p+ R( v8 @/ R4 r, }6 c
* ?1 G, ?8 o# y
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
1 g# k9 Q# d+ z: c. q$ m
6 c! l, H+ A. Q
& H/ a$ v, T, s2 ^% [9 \
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
3 q& g9 [' s/ ?* W
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
3 F6 H' z7 a2 x
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

3 z  _; |2 X% B! j6 g4 R8 L& Q
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

- y2 x# @! _7 h2 ]

7 j* s/ @; T6 @# P. Q

# [( a3 S5 L5 e2 O
在data栏中粘贴数据,如下图
3 _, u# I1 E0 V( h* A
+ X+ f) L1 u  c
+ U( m& s& J0 L# }( A* V
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

& F# l* p& k: W- n

  n$ F' q( {7 Y) P
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
3 H3 l7 {$ u2 {. Q0 T9 c
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

3 u$ v4 Q& x( y( E  ]% P0 N! J8 U

5 t3 G" R6 j# O2 K8 B
: r, ^# b" N) O/ o
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
8 J4 }3 k- Y! |' P

. i" a1 h; r' [, v( a

+ Q/ a5 w$ f- {- p+ ~  I; K
  将数据粘贴进去

# K, z, [  y. N7 }

/ n7 Y: ]  a6 T& D: b! a

# A7 Y" }/ y* m% ]
  软件即时生成的图如下图所示:
9 H6 l/ }2 y0 P6 L
! _3 u+ M6 T: V  S5 J

0 ^9 P: r% J  G
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

2 U: l6 l8 u- g& U" g
2. 柱状图

7 z9 ^9 W; p( f
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
( f$ D; o& }# n& Y' t( N
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

# o- s$ _! Z6 X7 u, n
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
- a2 h) f4 G% ^3 p5 i
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

# Z. d$ b; g: Y0 c5 B. W

. C/ E. N0 G, ]. h9 V

, B6 k; p9 z5 V! B8 h% g
在Data分栏中输入以下数据
, @% R' y3 R) e+ ?2 d3 ]
8 X- d" V: M/ c8 K  d( O# ~

8 n: b/ W1 A# ^8 F
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
  X5 y3 J: M" l7 O

" v9 e5 }( k6 t0 x
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

  p7 P" l; b: {6 ~( O
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
2 p% A! G0 e  P- S4 S2 F& n, j
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

' K9 L9 T5 R  X9 o! `, c3 l

8 A9 Q4 r; X% R
8 Q/ c- m' i5 N) w4 N; ~4 i$ n
  在Data分栏中输入以下数据
+ v  Z6 W9 Q# U% E9 {: M8 Q3 D; Y% l  B& F

9 M0 ?, k# q8 u. `6 x( t+ |

. S% l: \8 Y  B" \& I3 d5 q
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
' [/ [+ V; I" I7 ^

) Y2 v$ j8 R! E  x3 h
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
6 R0 T) v" x( b& f
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
& t8 }, z. R2 g" Y! ]
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
( A6 s- `, M0 Y5 J/ C4 Y7 A
1 y: K7 V# ?1 }. u. P; U1 ?( p5 @6 Z

. i. j6 c* F+ u9 r6 m% ?  _
  软件及时生成柱状图,如下图

6 j" y; p  d+ Q. ~6 [4 N5 S' N, y
# e6 \. n, f4 \, f- o
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

+ J+ w! o. p% D8 s- a4 T1 A
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
+ \% b& I9 v/ k0 {& _1 e6 L
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

$ ?$ P( W+ P7 w, D  v+ W
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
9 R2 ?# q1 `/ L
# }- E: ^& o3 L

) Z; f1 ~3 d  R+ }5 {$ u7 d
在data栏中输入数据

1 |. B) t& W4 i' |
9 ~8 ?0 ~* K1 e- P. w* a4 B# i0 c9 _1 c9 Z
, A8 D% K# `. @8 b/ ~! p( H
软件即时生成的图如下图
$ X, |4 c) m& ^

: _& ?5 \) \, b# I% {

: f' ^9 F! P/ v& T; V/ W) K0 S
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

- A8 N; C/ z9 _* K( W( e" a
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
' \' p3 B  ^' |8 b7 r
3. 组合和导出图片

6 F  g# j' B0 b( N1 I- l, s
点击layout栏,出现下图所示界面
" I8 p1 s; i8 Q( Y- R% O* p. G

  \- D* ]* N2 Z' `
7 b' [, r, M8 t4 P, c; ^

+ F$ m$ `/ T5 c/ W+ U) K
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
8 I$ I; o7 j! c( o/ Y- t4 T  D
" D* {7 _0 v) e7 K$ h1 n; U" Z

6 X8 E6 ]. {0 A4 x* T8 p" l! d
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
. d8 e; @" ?6 c+ J$ j1 N; p
; \, ?4 ^9 N0 e, r+ w1 d
8 ~) A8 E$ v+ X' z7 s. @
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
4 \, ~' F# t" U, W2 B
9 c, {5 r! J/ _1 _" t% P- Z
1 q8 C. {7 @- Y+ ]
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
+ H3 |2 g$ |) X# [
0 v% N9 C( O6 [9 ^
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!$ b8 i1 P4 Q, m4 ~. y+ `" w

7 E9 o% @+ `# |* S7 J+ D, ^  T4 P" B" ^9 e  t% M, }; I3 ?
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12; p5 S! ]7 u  ~2 K* s" Y; ~
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
" d! U2 U& T- r! e) }, }8 W& e
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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