在线预测蛋白质空间结构

hantavirus

有一个最简单的方法就是把你的氨基酸序列粘进http://swissmodel.expasy.org/workspace/中的MODELING中的 Automated Model模块中去，等返回MODEL 的结果后，下载你的蛋白的PDB文件，可下载RasWin或Chimera打开，就会显示你的蛋白的三维效果图，就能找到突变氨基酸所在位置。比如是跨摸蛋白话，则可决定是否位于跨膜螺旋区还是膜外膜内的Loop区。
但如果自动Model没有返回结果，说明蛋白库中尚缺乏相应的具有较高相似度的蛋白结构，这样你只能手动或通过其他软件进行预测了，不过获得的结果的可靠性也相应低了。