设为首页收藏本站

中国病毒学论坛|我们一直在坚持!

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 2598|回复: 4
打印 上一主题 下一主题

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

. S8 Z" i  b; `0 U0 y. ]
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

3 K' J0 j; q) p: Z; @
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

3 |8 d+ o8 v  |* h6 V" J
——正式开始——
) e$ o7 C6 J; B2 J
1. 折线图
, S( L; R! _( A; y6 o8 Q
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

' S# E4 ^$ }# X+ j
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
( a6 E$ j3 y* N; Y% |2 B
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

+ P; B) e& O$ f( |* |$ N2 S0 {
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
( U( H  Q( O6 r+ M; Y
: V- w% h8 X8 F5 j. c/ ~: X; f1 p

6 F+ K+ t, e& R# c4 o! B% P" H
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
' k$ \2 X( G& E; K# f

1 N/ L+ \$ c+ K0 ?% N; `

* G6 u( ^6 T  k+ l
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

7 V, [9 _& u" ^4 r' s2 `

# @( N8 z: g' `* g6 ?& i; s% k4 t
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
# U; F) q0 O* y+ U, D$ k

5 N+ `8 x5 w) D: Y# t- M* ?! |

2 j! N+ o& E% U, Q
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

* ?( b1 m3 c. Q0 X

4 m5 _" T, J1 [$ X
% w+ H  K9 q) b6 z
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
8 N* _) i# j2 W3 u* J4 f' m

" \+ [( G* @, P) p% _5 o

6 L7 J6 G! u/ z8 a! B  ~
  在Data栏中输入数据
7 |" O$ t8 L, E; Z

# i- N$ G" @* C6 o9 A
- l% X/ A  X# l8 Z9 [0 E  s$ H/ |+ [
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
! u8 {' i; x! b9 n7 M

0 z) W' r. ?( j: B! C) j7 i; B& J
9 M7 l1 X$ _# Z; E1 E/ a
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

0 t$ i& H8 A3 u$ O$ S
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
7 y7 D! }& `' ~! h7 g8 ^( N
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
4 u) n0 b' Q# f0 d; g# U
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

/ U5 F3 r6 h; v, L3 T+ r

9 N2 w; p% C1 r) C# Z" a% n# d

. Q" C  L! U2 y. ~+ t9 |% A
在data栏中粘贴数据,如下图
6 d+ i( B% ?9 k* g3 X8 q$ q

) c4 F% w- z. [. s) Y
" t6 O/ L8 }' T( q# G4 l# W2 ^. l7 s
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

$ h- c% e! w8 u& V, S

' q, x) z4 E# [: C
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
0 Y4 j3 [, t5 {- r1 R
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
9 F$ g" `7 V8 u% j/ X4 o

, X: p" m3 @6 I" r, `2 Q3 w# ]
8 C, I5 q8 k  p/ J4 ^8 M" g& ]0 s
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
' V2 U6 N8 G+ {/ X
3 m" r& x3 M$ Q

/ Q7 N! i* J  R( @
  将数据粘贴进去
% Q  E. |! P  [6 o; M7 S$ W* B
" t6 D* T- E9 m! j/ [# s
% i0 v9 I  l* x# {! M, k& z* P8 W
  软件即时生成的图如下图所示:
) p, k' }3 ~% }7 l  t' a5 T
. c5 L7 y% F- s! Y: C* A
- T3 c. u6 i2 s
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

9 C3 ^0 p2 q7 ~& Y' T; i
2. 柱状图
- h* F' U9 W/ r7 X$ n
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

+ i; D$ U" [& q+ w# t) h
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
4 E7 K' ~6 P& h; j# R& }  P# A
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

; q- i) D4 Z3 V0 s% k% w% W
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
6 }! i; S, `5 Q
9 ~. |/ @' r2 e$ r0 ^1 |
% h8 U" A9 L: b$ m6 Y3 j
在Data分栏中输入以下数据
" u0 @4 r5 E& Q3 k2 F9 M
5 x5 z' C) y0 Q3 r" H

+ U: I: g. h9 q
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

, ?- M: W, {. v4 t; |2 e

6 y! s! W* j. ]. s
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
0 Q6 F; V8 C6 O+ v4 k% g( a
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
! P( J3 p' m/ u$ e, x0 D& b0 J! G
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
4 P1 P( k" d) J) X, t7 R4 l/ K! v
. Q% [' q/ }4 }0 q+ ?6 {' w, Z% Q

3 W$ p) j" E2 P( D( U
  在Data分栏中输入以下数据
/ t- |* B& y4 F& t2 K
; m, a% g$ s' o0 J/ c8 I7 e4 @

  E# u' _3 I$ t  z, _1 S5 _
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
" C" S/ \  P- G, a4 q

0 n4 S5 ^$ @( M0 k$ ]5 l) p1 I" a" c
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

) z1 `; W; c8 \0 d. i
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

% |) m% u( X, I, n7 y/ ]3 _
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
4 y$ f1 e  g2 t( h1 |9 ^9 B

0 [5 S, S3 S) G" f5 A$ k+ t- G

. z8 L4 `8 a* M  u7 T7 I) m5 Q
  软件及时生成柱状图,如下图

  a! q) ^2 J. z5 a  |; W
" ?/ }# v  I. X- O- N
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
+ Y- U* k- S8 |1 v0 X3 `& s
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

4 }' x" t3 E( T+ A% D$ V; R
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
- U& d6 b/ |1 _* K2 ~- a6 c
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

8 r1 V+ G9 x6 E. x
9 t3 f/ N- Q2 g% X0 n

5 V7 R% Z7 W6 w  ^: Y
在data栏中输入数据
/ ^, \& W9 X6 D: i! `
* _! i* O+ Q6 Y6 Y, }' s

% H( a* t$ N' i# V8 {
软件即时生成的图如下图
' g& p9 f1 F8 j2 l# N
- W, ^2 o* [/ z3 T% Y

6 ^( Q( V) W4 i3 K& N8 s7 t
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

/ r" |; D' U  D# W+ [" s
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

" a" {3 Z7 P9 k' o" T! N8 P
3. 组合和导出图片

  h& \3 i0 S5 i! k  Y/ k
点击layout栏,出现下图所示界面

  e# E' T7 ]8 c* ~% P7 L

' n7 W8 Y2 s: E% Q6 ]  Y2 K

" y2 _2 k+ e5 l& {$ [6 p
* _5 }' ^! ~+ f9 u/ ?3 ^
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
/ `! b9 B7 G5 \# P
( g5 Z% }& B' c2 n9 h5 @& O

( Y( `- x, {* e) O0 f
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

# V# Z/ ]8 N0 `' x& u( t
& @/ C4 |9 L! H- I

8 Z4 S- R! N$ m( s* a' V1 }& J
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

) |4 l5 I3 M* c8 Z) R' X

7 S, u* @: z# J+ }3 T' J' @

6 B& l/ U2 T+ ~' H* @8 u
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
* A8 d' Y; U" g! ?+ F
% N- z9 o0 g5 n; H0 T6 Z
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏1 分享分享 支持支持 反对反对

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

228

帖子

549

学分

1万

金币

禁止发言

积分
549
板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
( e: F+ H. o; y" O& a& q6 H) [  {满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
+ G5 Z7 M4 y& H  ~0 j  E
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

帖子

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

Rank: 2Rank: 2

积分
3
5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|论坛App下载|Archiver|小黑屋|中国病毒学论坛    

GMT+8, 2024-6-3 01:30 , Processed in 0.199355 second(s), 27 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表