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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
4 M% L. [% H, \" Y/ t% A+ I/ i
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

. E8 p, b3 g2 d. y6 f; ~; c; ]$ T0 x
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
% u+ v: C7 S' U1 n
——正式开始——

6 {# Z/ D3 C, [+ U) V
1. 折线图

+ I8 p5 F" Y9 y, m. r! u
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

+ }& t# T! F  z% u
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

6 L3 d! A% T# K! x& U' @2 x
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

0 O1 a8 t8 f$ }  i* N0 G# z# H
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
! i* v4 k2 v( r7 ], J1 ?

5 Z1 L  _& V  Y1 F$ R. L
. g: J3 Y4 ^  @. |) m3 z
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

6 P2 q; D' p/ f# X! i
$ d/ A) L) [# U7 b& s

% ?+ p7 ?* A. z( s: p
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

& p  C! i  [, j

+ M6 [7 d+ }5 w5 [: g4 P
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
6 {2 ?) a5 ~2 f( X# ?8 R
0 e' v* K" {, G; {$ {& h4 F

: F+ g0 H; ]5 m6 j& E1 I
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
9 p4 T- R' I; I! a6 c0 k. D0 i( _

6 s* D( P' @# s7 l. Y6 _* w. ]; w1 j
8 s. I) [! v) r0 X" F3 b8 [
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

4 B( }, ~) F! W/ ]& s& q
" m6 F2 A  A1 X& T( ?

. \# c: e6 e/ L( e( F% F
  在Data栏中输入数据
& h' s+ U: C/ P/ a$ \+ L

5 L! a! y& ]8 a) l8 Z' @, x; E
9 D. A$ ]5 t" i; c; _
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
% ]) L* g  A# Q3 K" S
* ~, h( X8 @0 k  n( |9 J
% m" k* Z9 \0 {. y+ f( M2 Q; O- J
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
5 {* o+ G) v* k' y5 P7 `
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
6 b/ ]" [  |/ ]; A0 l" v. K
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

& A; }0 I, W: E" \4 \
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

- Q; H& [/ R0 ~" @; f2 E6 {
5 g5 g$ }  E' f" L8 I

2 K, Z4 d2 h# j/ p
在data栏中粘贴数据,如下图
% [/ v+ N4 s+ X7 U, B
, t* Q: S4 R; ~, p$ l$ H

8 ~0 m, u& P1 p8 T; u0 r
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

9 A6 K0 j/ F$ f7 Z! F$ M# n; N
# k, I# d: @6 q% j5 q* |0 K
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

9 k% T2 c7 f7 v4 y8 {) S# h
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

  t) V) G8 M# F% F1 K5 E

( Q/ V- o2 }9 ~  u$ h, a
6 W& K8 B1 S' a9 `  b: B! k
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
6 M2 U% b3 g& a

/ u7 J2 Y: O# f2 a% J/ O
  J2 }4 h& l( M
  将数据粘贴进去
! s' q! |9 m1 |0 [# t

/ \  c4 h* w9 ?5 \7 u$ o
* J' j/ W3 E- J$ {) K3 S7 o' q
  软件即时生成的图如下图所示:
, q5 a: B: o3 ~+ o

3 g* R% V% N/ [  o& e9 H

- u4 o* A7 y  Z5 @! A
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

/ g2 v7 ^* w2 _$ W4 v- }: |
2. 柱状图

$ ?# ^2 d7 v/ n/ U' Q
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

9 T, J* H% @2 @# H$ e: O$ Z
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

8 j! \) g2 H8 k* i
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

) J2 V$ c; t" c" o7 J3 S. F3 Q: P
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
) |6 ~- \2 U: ~2 {( l6 }

8 m9 q: e6 a& L; h. |/ `

( T; t$ M; `3 g
在Data分栏中输入以下数据
% U2 q* e' @  u! L. d

) L/ r& P4 L) f1 b3 v: r
/ d1 N0 q( Z* ?! J# U' y! y
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

3 _3 T& g) M$ Z/ d" {8 i+ Q4 B

# [) W8 D  C- F2 U, G$ R+ r7 Q& b
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
' G8 K. x& F9 m' J: W: {
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

& Q; }6 T, ^5 n# a0 {
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

8 H! i" \) ?) }  _" S* G
, [% h! S7 z' \- H
( ^5 V( L* N2 d. [. x
  在Data分栏中输入以下数据

- C- @* [  i2 q& u( c  I! K

4 r2 |  ^: j0 T8 U
% A: i2 r1 f& e* ]( Y
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

1 i! m0 I3 }) _' v, q2 y
9 {  q+ ?4 h  V
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
! @) ]* f/ T# _
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
$ A7 x( _) V0 p; ?
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
" g# N* k3 I' n
. S- D% {& S% T( O

- k* t$ P9 `- |: `3 O) r
  软件及时生成柱状图,如下图
( a: E1 F3 u  x: B3 y' Y& v# {
1 F  J9 x; }6 T/ P9 S2 e$ z
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
0 A4 j: H: f: L: e) z# r2 K
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
; w. Z. ?3 p( P! a
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
" I. S2 J. f0 `: \* R- F- |
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

0 p3 U  @' F4 [* b. ?
$ ~+ B, O* \3 Y
5 \  k. I: A- [9 t
在data栏中输入数据
, O; z, ?2 P( E# t$ Z; C3 I
- {3 T5 ], O. {3 h

+ W( W4 l3 Y4 L/ c2 a8 @$ a
软件即时生成的图如下图

" o7 r3 z( J, k

5 A4 T! m% I8 `5 I1 G( N

' `1 l# V5 u! T. x$ H
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

4 [  p. c( h% S- a4 P
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

- D1 ^* i9 [6 E; o6 q! ~
3. 组合和导出图片

# k. P0 b7 k" R7 \
点击layout栏,出现下图所示界面
5 w6 }8 G! H9 g; C( a
1 i- b* [- u- {2 L/ V  `3 i) J
) Z7 A/ X# w3 ~5 ?; X" U
' J+ }$ g( B; _; Q: M
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
, D: W* G4 E0 I9 x) T7 L3 _: C

0 p# I& b; x7 j7 [5 m

- Y3 j% H- x+ f! Y
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
: O! X9 b# d( z& v' v7 X
0 Q( f/ C! E4 }0 N# L0 K

3 h* |, k! A% J: J( E& t, T
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
8 g; [' i7 Z' g# C% E

# E# i- [4 ~+ H
3 i1 ^7 ]6 E- v& S+ T
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

! h% ]( x4 R" z5 O

! P5 ~% h7 Y0 s
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12# Z/ S* u4 U) Y+ H. Q
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
) L) q( w; c3 e8 p, z  d
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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