设为首页收藏本站

中国病毒学论坛|我们一直在坚持!

 找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 2782|回复: 4
打印 上一主题 下一主题

如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

[复制链接]

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
跳转到指定楼层
楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

& ?+ O5 Q) g4 L& b; _3 m3 Q
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
# R6 z* M* A1 G# o/ ]5 D8 d
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

8 S+ X) C% s& f. I
——正式开始——

1 n4 n/ e* Q0 h; `
1. 折线图
9 Z/ ]5 _9 s3 i7 z" x) R$ F8 J) b
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

/ V: K. T" m, z5 c( M5 Y4 P# e
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
: E9 e0 @( ?6 Y% t! w/ z2 Y% H
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
4 `! W1 Y! C4 l4 _" d2 `/ s
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

8 X" U. G* ?, a7 U6 C+ J. H. k

) W$ l/ T3 g5 {) A. w$ [& H1 H
# X) c+ X# j* ]. M
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

/ r8 c, f+ R* L/ F1 J
& z% r! v; l0 @; Z" Q' S, Z2 }, T

( O, ~4 u& M* v# V7 a6 \8 i- z& @
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

$ [1 ~& t& |8 \' s6 r, ~8 l" I

+ ]" W5 H6 T% E. ~. V# ~
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
# T$ }" f$ J' V4 Z1 M& K$ H4 s

$ {0 g; R" P  j7 A) i

2 m. f6 s' N6 i1 @& O7 ^  [  a
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
( p% w" p# o7 j3 J4 G* h- s% Q
9 b" o6 j4 t$ L' t: Q; e

; x& i- v, d8 Z2 _( M, p6 ~
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

! g" t$ X- @) z
7 s8 _8 B! m* j1 m! w: v5 r% P
0 M2 n" S$ U' P# x7 r$ @5 Z
  在Data栏中输入数据

" F3 h! ^* D7 B2 ?# \3 n" q' E
& S2 P. E) l9 ^

- g$ F8 p  l+ A2 {9 `& v- ~3 b
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

$ `" y2 Z- a  m1 I* s
: ^  w8 \( U7 o# B0 Q3 ^
+ P! _( k, e0 q8 a" `4 g' r8 e
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

, ]! W7 E& Y1 U$ j
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
) Z# z1 X4 n8 y2 K8 {; a
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

9 P' A4 R- X) S& A3 y; ~% t" h
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

. D" ~- ~1 \: i0 L/ y, y9 i

& P; k  o) G# r$ d
% \3 l& P/ L; U6 `. w, s/ ~
在data栏中粘贴数据,如下图
1 z% [% Q4 m- E! l
& M$ N. ?) P; `0 _/ t: T+ j

! X) O6 W& |/ N$ E
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

# C8 r7 w! z$ v8 F  t

1 P3 w! Z5 e& D% p
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
& @1 ]- d( L9 j6 y( ?
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
, q& t, X. z, ^, |! t- d

+ V6 D+ E1 p2 K9 u5 T
; |2 t0 H* z2 a% l$ Z3 o' ^) p
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

4 l" f: m: t/ i: z6 W! f1 N  W

# @  C7 s6 Y0 d5 N) i7 L/ B+ B1 Z

6 Q5 }* X0 z4 ~3 J. q8 t; t
  将数据粘贴进去
0 o  X, A3 r6 y' f* z

# k* t0 ^/ Y; u7 v: W

: \/ U* Z5 c. x( R8 k/ G
  软件即时生成的图如下图所示:
9 V: |; {* M. W$ ]. t

4 C  Q5 t; `) f" p
9 Y7 R# j( ?, L2 R; x
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
: [" C) `4 w0 W7 s' f/ `/ h
2. 柱状图

) P4 N! A- z4 M& `. h6 W( g7 ]
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

! S3 J" @  C, {
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

/ e; d, Z/ L7 ~2 T3 U8 b9 v2 w1 I
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
9 C3 G" d# P, R$ D. U9 X$ B: H
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
  z* ?3 l- `7 N& T' k$ K9 @9 U
& {7 J4 w, L( F  ]  n# e  }
7 M& Z' ]2 a7 v& J* b, T
在Data分栏中输入以下数据

, J( E7 t+ D* U: h8 R
4 I7 Y, q9 _$ d6 D# ~( h
+ ?0 M' A! v2 i9 ?! {1 k0 c) H
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
5 {- j6 _+ M& Y" Q

* r. y. C/ w/ M: w( H: B% ^
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
8 Q3 J" u' U% ^8 S6 h
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

) }' a1 [, F( L
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
$ p4 V! t! u" {6 Z' \

( y& [5 o3 H7 @- A
! d5 s7 m4 p# Y# _: J
  在Data分栏中输入以下数据

3 M; K6 E3 F# _  o8 M
0 `: R- ~+ z* v9 `  u3 f9 M: G; Z

2 f- H" V. r  S. M
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

0 R3 E5 \) A* X2 k# x: r0 \
2 p, t6 Y$ x$ {! W; v# [( I
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
: g7 h; O0 M* ]7 \# O) A
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
( {7 H/ K5 T! n
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

  L8 {* }% i% i0 ^

0 M/ `4 |% Q! B& S

% P* k( B- i' d; C5 f+ q
  软件及时生成柱状图,如下图
8 U" O5 L; h% _8 e0 x
9 `6 e  ^( n/ m
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
$ s6 x; g8 P1 A; s. u
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图
( W6 P; S  [7 z+ W) `6 n" N
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
* {. F& i: Q: K5 r' V
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

0 n. `/ K; R- E- Q3 L5 ]0 K$ b, s
$ U# n/ ?- g) |6 n" R* Z
4 s" c# P1 C0 e7 r8 Y
在data栏中输入数据

3 L' E  n' E) Q- L  O

$ ~' V& X" o5 b/ |# `' g9 m
% l3 ?+ Z; m! f" q2 r5 i5 p4 g
软件即时生成的图如下图
. w  F, a! P: V" x! |7 K

% Y( b" H$ H% F3 J+ B

6 \+ L2 d) Z- f/ S- R
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
4 }+ u/ b9 v6 e0 s
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
+ j& \$ d6 p+ d& s6 u
3. 组合和导出图片

, ?% z! e9 e$ E- s
点击layout栏,出现下图所示界面
, {  U8 k: h" ~7 C/ K

$ D# {: R* r! k

0 F" ^( b) i# P. P
0 C% Z: j) G, K' @7 i0 U/ w/ m
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
! }! [% K) o, c, V

* B* W0 g7 h  x# \$ b, z1 f6 p

9 ]& b' U6 v* r7 a$ ~) P
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
& l+ Z, {6 m+ u& p' w  C. x
: `8 o3 d# G/ a" x2 u* w+ \
2 |# s: T2 x: J* V
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

' Q! m- A) T1 x# U: c
! G2 l: E5 i: ?

6 P- B1 M+ y' X1 h) H
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

! h0 d2 H6 d9 d' ^# D% O
0 x: a# e1 u2 V
分享到:  QQ好友和群QQ好友和群 QQ空间QQ空间 腾讯微博腾讯微博 腾讯朋友腾讯朋友
收藏收藏1 分享分享 支持支持 反对反对

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

228

帖子

549

学分

1万

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
549
板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
# P2 C" X5 Z1 G3 R3 N  `
" O( x# y1 `8 H3 n2 e+ l
. K  L, s: s: @& R$ {比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

104

帖子

62

学分

528

金币

论坛元老

Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10Rank: 10

积分
62
地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
, }' O: g" w, Q" b9 l满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
, k0 s+ @  A' ~6 H$ }9 L2 i
刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

帖子

3

学分

463

金币

病毒学院小学生

Rank: 2Rank: 2

积分
3
5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

QQ|论坛App下载|Archiver|小黑屋|中国病毒学论坛    

GMT+8, 2024-11-23 08:56 , Processed in 0.156339 second(s), 30 queries .

Powered by Discuz! X3.2

© 2001-2013 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表