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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

' I8 H) C/ S+ ^+ g1 m- Y8 d* H
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

2 C$ c9 r; c2 R& v: ?2 k
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
" t5 q/ V  K9 R! v4 d
——正式开始——

+ M1 b/ J( |' ?; v7 e4 d: Y
1. 折线图

% e8 {. |9 I/ F* _6 y3 P" C, T
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

# B- g* z) Q6 h5 z& I% e
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

! s' b$ e* u# u3 S
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
3 E! |0 u3 P0 k% A6 p3 H+ _1 [
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

- z+ }$ z9 t* R8 A1 r; q! o

3 Y$ B, T) S  d3 h$ s/ T$ u

) M$ A3 v+ o8 c1 p& T# [
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

! ?3 j+ ?5 l0 n8 Z
/ g9 k5 b( b1 w- t

' z* x/ s& O. l2 Z
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
& _9 ^' V1 x" P# C) X) u- T
# h4 `" L  E& X' i1 w
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
! O8 z2 P* Z4 m" a
: M+ t$ [$ Y& F* q& Y* w

( j$ X: N) P# n$ c+ ^3 W
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
5 e) o8 O- M( k  U+ p
1 ]+ _: ^. j& Z) U. `, N

: K9 ~- O) d2 [( A4 _& {* L
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

3 Z$ c9 Q$ s+ M/ S: E+ f2 H" y/ }' p

8 i6 p: [5 o( g& M
7 R3 X& Z' j+ w6 _! b3 T
  在Data栏中输入数据

' w$ q& N6 {+ \9 b2 G( q4 d

0 L5 g! u* \( E! ?3 f8 B' G

( A& }2 s5 e$ D
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

* F& Y- H) H; `# @8 X9 w

7 @) l) i0 ?( K3 }1 p

. _$ \. h+ Q4 q
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
; \8 H+ f9 y9 w3 i. `& D* [: ]! ]; u
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

% ~: e! Y* w/ l' i0 o% k
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
9 U; x7 N, w! w3 L
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

% E! t! O% Z5 l6 U; k) K

8 c4 m  j2 w+ F7 E2 P. }' F
# Y. a0 v# ?2 K! H* N1 F
在data栏中粘贴数据,如下图

+ l" i: `7 J& O% d1 S1 i% g
* f3 E9 j, x" a/ I# A$ G* J  T
, T, A# W0 m8 B5 h$ P: I
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

; w4 Y* ]$ Q, S6 m$ T9 T- R5 C' F
$ G1 p& o7 V" `$ Q0 |
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

, r5 \9 e4 u% z6 ^, }
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
) \- D9 }1 G% R  C1 X
$ F7 G! d& x* Q! `
3 @0 }6 |' `/ X, T
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
" g% [1 g9 z- `$ e- }# p
4 Q1 V" \* D& ~) l8 S
+ U! z) Q" C# `/ v3 e  W
  将数据粘贴进去

* t/ ^, u# O' ]. ]2 r; ?
- M  z7 t2 u7 @3 ~2 v* E

3 K+ o) J7 b; E4 {  z% h$ q8 I& {
  软件即时生成的图如下图所示:
; H2 {: o8 V: ]% j+ i8 B
' @8 A% w3 I8 R+ S

! Z; ?5 B, E2 U; R8 W6 D
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

0 |! e$ S% A5 t. E8 h
2. 柱状图

& v* N8 Z/ T/ y# ^6 x  g. `
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
% H. H1 V5 b- ~& h& |, A; Q7 ]* \6 J
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

5 x7 b  y6 j: ^
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

( M# C+ t4 j# o7 W! E
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
! f, m- Y) z* S/ n7 \/ D' P, W- x

# q, {' u& S4 u  _* U/ \1 y' [

* |9 ~1 N. \, N' r7 L5 s" a# G
在Data分栏中输入以下数据
3 U  K4 r, y+ [/ _

. Q2 T! V) Y" f+ {/ V: b

7 a2 Q/ O: H# q& z: |
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
4 f. G/ [4 t% _& K

) i+ U+ E0 E/ c( M
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

5 {+ _) U0 U- [& J0 [6 A, x- L
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
! q; t3 X6 y! M( Y" I
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

2 ~' `" f& A7 q$ W) @( m" B
6 I% ~9 ^+ n# U6 v
0 o( Y  T* a- {7 S
  在Data分栏中输入以下数据
) N9 a) J, W" E! L4 s  B2 e7 ^

* j1 }' b9 u8 j

! }2 h8 P2 ~0 [/ D/ I
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
, L5 u2 b* @* Y  E0 ~; z

/ J6 l% i7 \5 l, ^- H, o
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
3 a8 ?! u3 m7 P' e) u1 @
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
8 L8 y& |2 |  y
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

* }1 H* J: G' A: c: p  {
5 F! r7 V; x, ?5 I. ]) S

. H7 f- m$ t& ~( P  R8 X
  软件及时生成柱状图,如下图
8 J7 b+ A( \% k

. x/ b3 @$ c0 B
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

5 _( I: R- q) d/ y; z0 H
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

, b3 g' j/ Y) X% E7 y
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
$ B( v/ }3 f" w5 h; ?! f7 W
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
* m2 u3 M9 q6 d; i9 ?, \
. y# |0 P) ?5 ^) u& G

0 W3 X/ h. ^; J
在data栏中输入数据
9 p) S3 r5 S; x  h

' b5 r' F: Q' F9 Q3 f
4 t3 b+ w* v6 V7 |/ x
软件即时生成的图如下图
( U# T* T2 I. }7 v: [/ L

. |: Y3 a4 D. w  B3 `8 j" ]# ]

$ W; n  @  `- S( n, I$ }# s
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

' q* I. o' E/ {4 W7 ^
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
$ [/ r1 r$ f& T
3. 组合和导出图片

; O8 H5 V9 {( O) F, ]
点击layout栏,出现下图所示界面
2 E* I" \  O6 g  t$ [
' Q3 q, P: O  V* q. t' C
- H) Z7 u! b+ K: M$ u
) ~' M; k0 u* w& G+ C
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

! L; i4 N( ?' ?& V# K* s$ H
$ J. N; r! f( g7 A+ Z/ r
" _5 d3 J  o2 d3 y9 p, z. e2 F
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
. `, g7 [8 b; N5 ~
/ U: O, y2 a8 c; R1 d

) v* Z; [4 t  u4 Q9 ^3 c
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
# e% w. H5 U/ [" N4 ^

7 u, e" Y9 @1 p3 o
# q& O& l* K. m  P5 O
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

' x& f8 h! Q: @( ?/ ~" O
& r" i! [/ p# k% m& l, o
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论坛元老

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
# D. J8 U# `; C& [. c
  s5 [+ f2 ^8 ?5 Z/ k) u3 ~: I; l* Q0 C/ V" j
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
! f$ j4 o) B* _3 ~满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

0 x* X/ V6 c0 q, \4 g4 K' |刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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