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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

  {6 p, a& s2 o
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

- D3 q/ t/ l: T2 B. L
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

. r- y' q! p5 u$ E* E. p( a
——正式开始——
; C& v/ c& x1 R) e7 B9 n6 B/ t* G
1. 折线图

; o( o2 b/ k9 l
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

8 }: P( R/ q+ S% M1 l# [
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

0 N' u7 P+ x7 D! Y7 F- D
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

# p) _: F" ?4 z; i& S
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
% K' q* D  c: ^

1 \. Y5 o" x! L

- T9 r2 G9 G. R2 d# M4 B
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
* l6 {0 H  n& f. Q- |

* W  ]# {, \+ M, L$ a& v) h

" l3 I/ q4 x0 A2 g9 Q
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

& m! X' j! L2 [" m3 r7 Z

+ e, v8 j9 P* M& f" I( D
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

2 F% L- W# l' D+ L$ \. g0 |% j5 ]; D
. J6 B1 U5 \8 @& @  S: o# ]3 g0 b
# c. o7 e- ~) {% c. Y6 a3 R
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
( l2 {" U3 V: Y" z7 j0 Z

0 c, d, w+ i, R4 _  u7 u& I

" h% L% i- s1 {% |1 i1 R- j1 ]* d
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

3 O( {" u8 e, Z7 j/ [
; I1 u7 A  C3 c$ }

, a3 T; L9 b+ d9 p, S- x4 C
  在Data栏中输入数据

  f" h) b# i( c: Z7 J9 e# P
8 c' W' _8 [/ p# o) _
- v& v5 d. P2 M0 T; T5 {2 H9 P
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

* y0 E( m7 o* f  C8 z% V
9 g2 w5 c7 x& r9 u

& R# R$ q; s6 q) E
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

. X$ f7 f% ?0 [- n
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
4 y! Y4 J8 o; v' r5 F6 `
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

* Y: N; T3 P8 i" P4 `
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

+ |0 `" z+ H5 r1 b2 s% i

: O8 {3 E& h: j8 t6 ?

" O3 _0 {& G8 |6 O6 @" o# H
在data栏中粘贴数据,如下图

/ @1 m+ X$ f; D- L9 g$ j$ c# [

& }% F" ^" ~. c6 q% V7 U9 B

" v0 P' u$ T+ H2 m+ ?. Y
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. S; R  W: l- O0 ~
$ t) Z8 a+ q, y" a0 j) l% [
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

  J" b' e  ~0 D" Q
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
. v/ A) o' }% V- M# v) B

6 d% `# S5 e6 r5 M
. R/ o3 c1 v7 N* M/ s7 c
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

8 X1 ^, X* w8 p; `* ^
" c0 L$ O, r; Z: C8 }: a

% o  G/ ~; X$ O- }- C* ?1 C
  将数据粘贴进去

& w1 {( o4 D1 g; x+ Z0 O8 H; ^
7 J9 W9 ^4 ?  E- ]

4 ?2 f+ b, F- K; c# a4 v
  软件即时生成的图如下图所示:

3 F# t6 f+ r: P% T( W' T

% E1 G3 j$ Q1 y9 D0 g

$ m4 j( R; n$ @0 ^: r5 L6 S2 {8 Y5 B
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

% Z1 z9 G8 Y7 p& d& K; @
2. 柱状图

$ S2 U5 H0 S/ `/ K. ~* d/ m
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
, C1 I8 U+ J$ _) b+ h8 Z
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
! X+ f6 Q( T5 Z% _# j2 o- ]3 f
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
; e5 g0 e9 w$ L( R) S" B- B, X' e
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。
8 j# A0 S# y: w, k( u7 ^& _9 d, w. W

" g% S+ N0 {; H6 _  {4 C
/ ~+ l% A$ G* x9 ?, t  C0 i
在Data分栏中输入以下数据

4 o, h$ w, c( V0 e* D
8 w* k/ T& N. ~9 c
+ u& p% Y# b) g7 i- E
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

8 p9 o1 H( ?! r0 e8 n
: ]9 l& r9 _3 f2 L1 g/ G5 B8 U4 [: V
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
# \, Q& s/ l9 S  {
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

. b0 q! F& N: @, D; ?" J; K2 u9 A
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
8 L# D+ S' i0 s# V: Q# \
1 C( L9 \+ y0 z, U& ?1 q7 A/ y

) H; [; x+ {4 Z$ g" A
  在Data分栏中输入以下数据
% U6 u! |, ]- [* v: Y6 w

8 e" O/ d' M( q7 F# N
) L- R$ c$ |5 d. f4 N$ a% Z
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
9 n' B9 l3 w2 f2 K/ a

, D2 X7 S$ J, {$ N
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
* @9 A& e4 G& ?8 l
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

) _. a  H( ~. d. |, M1 S" l- \
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

: z9 O% [- H0 Y+ m6 I/ m" N
# X! k, C) }9 `8 y( H

$ @9 T& j# z/ v# o0 W6 Q4 I
  软件及时生成柱状图,如下图
. _7 w8 Q! H! j  z- ^: |

, \; L, U% o  j
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

. |. O9 E* z5 @3 P6 s9 u
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

+ R( u/ V7 m" y' e' w5 A2 r9 g
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
, E9 i0 |. ~% {
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
/ N" J# V1 O0 s4 Y- z6 D: f, [+ w
* y% n( C# N+ I5 a2 D9 R$ f

% I- F, ^; H: K+ F2 s  [/ E
在data栏中输入数据

" J8 |: M; o( A+ K  u* k
4 E6 J: R4 }; Y2 ]

2 z. e; b: ~& k5 H# U1 m
软件即时生成的图如下图

3 U9 y+ p0 Z+ s9 |4 a

3 E& G% i# g: [  _7 c4 }
0 \" g, ^" A9 r1 Q. U& \9 e
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
' e# t6 ^: x0 B) t
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
# s+ I' R. J$ y) m6 f
3. 组合和导出图片
1 G- v. q* {8 P5 g" y; e
点击layout栏,出现下图所示界面
% v  v/ Z9 M+ w3 k7 t# t- ]
, v4 Y, {/ L' s) t+ S# I
+ E% R$ z/ t6 g7 K
4 r# t2 l% d6 A/ G
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

; w; J5 v  m% H1 Q: r& [' s" w% e
* u! V/ o( Y9 B1 {

* P; D" V+ ]% p. j" e/ m% o! m, ?
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

, P, `4 U: ~( D- u$ f/ ~# u  o

8 v# p. g5 k4 ~4 o
8 @/ w% v0 Q* e0 v
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

, E: t. P8 r0 t

5 m+ `* o/ n% u+ N2 ^* e% l( N
) _8 ~- A2 O$ N" v
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

; c  Z. m6 e) Q; B7 \

/ z. O7 x/ R9 J3 b* ?. H6 E' X
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
* W( V8 h7 h# K4 I: |4 K) r" [2 Y0 l1 m' _7 E. }* K# I1 D) g
' R# W3 x; n* Y. n1 l( f
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12- k& V& W+ u( u
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
" m' @& o. d6 o" \! ]
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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