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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |正序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

# o8 z' S: A: z0 C1 G  U
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
1 J/ Z  |5 E8 s9 b
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

& {" t5 i% N8 h' o% ^, X
——正式开始——
# r2 Q7 O. J& N$ g4 l0 b8 P
1. 折线图
! `. W) F, H6 J7 L/ g- T6 ~& M1 g
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
8 D# j3 N  ]! W
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
% F6 ~+ j1 C: C/ z: \2 W
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
  Z6 a  X5 D' U! @* a
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

' v$ @3 v1 d- V) z' j% Z

9 \" r. x/ Y- t" F4 o' ^* [
6 O- g: ^7 ^* U: P$ R7 S# A  u2 V- D
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

; J+ u  a0 U7 X! n* |+ q, p$ T7 y: i

2 L' O5 C* B; t2 z) z( O
$ M% S7 T2 ]4 e4 p
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

$ {( `, a- s; X6 f

& F9 k9 A( O$ I% }
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

- {+ v5 x! B- M8 L
9 \* H$ N+ Q. \

+ r/ k% M4 \9 m
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
2 K1 F1 R! q# h' |# M( B. Z' ]; l

7 \! }8 o9 o4 H! h! \+ W
6 E. G! B3 c, f0 [5 |+ U2 Y! |/ f
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

4 ~% ]: |3 k, Q" E

# G" x: \5 j# W' l
2 o  B% H, V2 ~; k% f$ h3 Z/ I
  在Data栏中输入数据
3 o: t' O1 `1 t4 Q& ]( j, n
& P7 U# |2 d! s: V$ U* b$ Z

! m8 ?/ ?2 ^9 ~, ?& e, R+ _
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:

0 n  j% n! h3 V

* e+ B9 Y: Y; W; O0 O
! ]5 ?* a" v/ N; `6 c: u
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
( V; Y" \9 S# G8 X9 F
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

3 i5 {( ~/ x( d! Y! d1 R8 v
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
; d; z$ k4 Z9 i# z& j
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

, O8 b3 o% ?% q2 I! J4 x9 N$ g; r$ b

+ R7 w3 ~0 q5 c  E
- v+ B6 K5 X1 t; g! `
在data栏中粘贴数据,如下图
6 p4 X& C  I( r; W

. l6 q" q3 r8 G
$ S- a/ i0 Q" q
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
+ Y0 m5 e0 O; X8 b5 J- g& ]. Z0 v+ d

. z% X% j2 W$ v
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
% c( c& x: n0 y5 X
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

% h$ N4 m! k1 l* K# ^$ T, p
$ K  V: _  p( J/ w1 l4 F3 p3 t0 n
( p' F+ N* w- C2 u4 H
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
& ^9 C4 ]; j& e. r1 _" n" |
  F) u) x3 _8 ^8 b* J& A! f
+ |" Q* i% \3 B. {6 _' S& H7 f
  将数据粘贴进去
( b' J+ x2 T; ]( _3 q
2 c8 y3 X: z. g1 F0 I3 }8 y5 u* z/ ?9 r

( p9 }7 k) B  Q  x! _+ w. \  X
  软件即时生成的图如下图所示:

1 T8 }- H# S# A' D
7 ~' L( L1 ]" l' b! Q0 N

" a) r4 e9 Z2 x$ G& z% f2 m  _
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做
. D$ Q) L# i8 R8 r) D! @) L, Q
2. 柱状图
. U+ l6 C9 w9 {- j6 Q/ W: L7 U5 `
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

1 M. Z* H  S6 `$ ~( s! s) c( u! t
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

/ p" ^) f1 Y* l
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

9 F! l1 ?$ k8 Y+ x9 l
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

7 _& C- o3 p4 a  N' J+ p

0 f* e; t, ~( V  o' |

! e6 X" |- w( f3 [6 q; I
在Data分栏中输入以下数据
  @3 P5 o# v4 I4 C9 c& t

: p4 J( b3 D- t/ M3 j( A3 p

' U, a# [' _9 h0 x9 q% k
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

$ ]" F0 G' H; @/ ]& t
0 w7 O' |* G0 d9 T1 }
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

3 @- i+ u7 l! {& {5 Z3 `3 V! U
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
' G/ Y5 D$ T; z* @
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
: q3 ?+ U9 @% h
$ u+ r/ i0 ]" R- u9 O& G7 ]! v/ q

, [6 G+ \$ W) C  b$ l% P! ^# k7 [
  在Data分栏中输入以下数据

' Q% n0 w$ S' y/ k( y( M* q7 o3 O
& r& n. L( U/ _4 ?: _5 Q, l2 C$ k

# T/ d9 G2 _& Q( W* @/ r' _
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

$ s8 z% ]( {6 q6 o7 A; V# Z
# Z6 s& J8 G7 B" v$ m8 x1 _$ Y* R
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

! w( q  P: ~- p8 ?" _
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

+ i% \6 k4 B# {: }$ w6 Z" ^
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

2 u8 e! D+ L9 o$ j
5 K& `( ]$ Y& b, ?- G, }  k1 E
, k- @" m& Q) |& s# S
  软件及时生成柱状图,如下图

0 Q* j# I4 ~( I

3 O0 |/ R$ H7 k- q* Z& F- ]7 k
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

8 j3 h* a# A  I1 x, a' \
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

1 r) R5 D/ S, k9 F4 ?& E. Q! H6 p6 P
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

- R4 o0 z4 e8 k5 d3 u( {
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

4 S; s6 e9 G9 A; a- d& x
  F3 o' F$ \' e" u5 }, h# J
! y' O! N5 Y! S
在data栏中输入数据

7 N0 J8 f, l0 P' a; ]2 v9 k

5 N9 G' n9 u8 _( P7 G
# X' D! \; L6 ]: A
软件即时生成的图如下图
2 E( ~4 [6 p2 G+ Y4 U( d6 }
6 _8 ?* ^- l  P; A1 _5 S+ @
0 D7 R+ W5 [7 F7 l6 M
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
1 T3 p% }9 R8 I
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
4 G/ t  _5 `6 J* M" I
3. 组合和导出图片
5 g' N: Z- a; |  E. w
点击layout栏,出现下图所示界面
$ W* V! D2 q6 Z( c+ f
1 F* M7 m1 y9 [$ j, a0 m
0 o: r! z: r, H7 T
. j! G; L3 S2 F8 I/ k# U
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
6 C* E, H# ~& i5 }- a! S' u  o* W

& C2 J% A4 ^/ U5 u( Q2 R, M# Z
. i8 i. m* q) c+ q5 H
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
3 m9 [5 F1 E! ?, t& f

( ?$ C# X4 r4 d' q+ |6 ?  c
0 r' D- K: g& }4 A
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

- O1 X& i8 b& b$ |. C
5 o9 _, }: u% M

- E3 ]- d4 M* u4 H# F& F
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
! e& k2 S; o# N$ Y
& }) {* u0 j& P; j! i5 u- q3 I% `
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病毒学院小学生

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!

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论坛元老

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 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12! ^  x2 s) U* o: c1 |( Q* I
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

& Y- s6 _* ^5 }) F  c& u/ t刚好微信圈有这个,就转过来了。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!" G" w; l" n0 n2 U1 B
0 D) E2 N2 K: J6 ]5 f  I# s9 M

7 b7 Y+ C6 T2 W2 f" }8 s" h6 k0 ~比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。
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