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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

; s. V! |) t/ P8 ~
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

1 X  |$ ~9 u* H
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。

  N/ ~* \  c+ ~: l/ o% h
——正式开始——

. E0 Y( R: d7 N: z& N2 w+ D# W
1. 折线图
+ a1 C8 F- q9 i0 U
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
8 |+ h; V" m- M5 b
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
4 K/ }9 o# ^+ M
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

5 C9 ^0 F  f* C7 K7 [+ g8 Y; @: M$ a
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
" C% q% F- @# W3 b
4 s2 h8 B. V, c  U4 L4 `
7 w3 N( J3 b7 x& @/ D, a/ d" P* M
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

: t& j# B( W8 w
1 B; N7 s- Q6 G3 L. a7 c* u7 t; Y

2 Z2 L" w" g5 v* `; ?! t$ r% A
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
6 c% i4 c9 y6 ~: }7 ]" O4 `

# n6 D0 M2 J9 E( R" t9 o+ h
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

' r( S& ]1 h5 e; I% ~6 D* @
  v0 h8 i3 {7 c1 z2 _% k
' U; a: T5 V# x( ^+ w
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
* |4 ~3 i) Y# T
' d: L7 d3 {) P' |* r
) z  e7 u8 I3 ^% v% j
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

8 z% V4 {/ ]+ D) V5 ~* @& O" \, _
$ y; a1 V" b  }" T/ G, |9 q$ }7 f
7 v; b& \' v$ y
  在Data栏中输入数据
; F( S2 F% s5 I- b
) Y% |' [  v% g8 }4 a1 Q' Z
& `0 u9 W! k& F9 `, [+ Q
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
$ P* r& V- Y. x5 R- ?

, s+ y0 v  E& w3 P& j
" a+ q% Z  o+ e) [
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

# l2 R* y; S6 m# f/ z
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
7 ^) t* l4 A; t
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
3 c) D9 K4 N" y
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

0 g+ M9 L& u- e- H# u' r/ ^
' x& s8 O( X" X& Y, H
$ [( @: I! q8 K+ r( S, u
在data栏中粘贴数据,如下图

& k/ s/ i5 \5 ]" R
" c7 _$ H3 P" t" C

. Z# ?1 d( g. @7 r  I. L
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

. `+ `- \9 K% m# F$ L
3 z* ?5 K5 o( _9 N6 B* I+ ?
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
# F/ h( B" G3 A7 S6 o
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

; p. a% ~- e+ D/ K2 |+ _' ]$ ^( ]

5 ~7 Q- m. H6 p; f% K) m
. ^3 H! m9 _  I0 K. @0 d( q3 O( P
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:

$ k) W( h$ |. {

2 Y2 T& a* a! J4 S! k) f2 s

/ z0 U. P) }8 b) @6 O1 L$ t
  将数据粘贴进去
: J8 k1 S; p8 T# s" r9 e9 |) o

3 ^' i. d# }9 e: Y9 D" [; p

" t- I! o( g8 K( `& x& k; }+ f
  软件即时生成的图如下图所示:
, L7 p4 ]4 p" X. q% m  |, |
/ X' S8 ~. b7 T( P8 ]

4 d/ g$ p0 s! F8 D
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

* b% x! S/ j1 \6 A: D" [
2. 柱状图

4 |* d' ]! {  X5 u8 @0 M
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例

  `& g8 E4 q5 O9 m3 o# U
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

  H4 d+ q, t  i' P/ t# f$ K0 r
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

1 e: @- S% d8 _3 a9 b0 A$ O$ u6 S
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

3 F+ k" K7 }1 j$ _
& g5 i7 j" ]7 a8 Y9 |

: B5 y( Q: P( P% d' {: {. _
在Data分栏中输入以下数据

) e1 b5 T. B  L+ B
% \+ a  m3 o% K$ f+ \) o% s. B' o
" l( K! Z- c" c) `1 H: a9 B
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
/ w. C* }2 S& q; u9 b
$ ~8 b" v3 {% U' m8 t5 h
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

' J' W- h2 ^  v& m
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

- A! x: e  r: t; y  _- E
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
2 N5 R) H9 v" u, V! l5 d
0 p- m% V3 W; m8 L6 Y6 I
- b) R! p2 r# g9 I9 g* }& z
  在Data分栏中输入以下数据
& f+ `3 j& t* H. X

2 M  ]% M1 a; k4 W8 j& g( P1 A4 ^! F
5 a0 f1 J/ a& S* A
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
$ ^1 A: R. U; q6 Z- Q
( ~; Q) Z. ~# p
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
4 `6 W& Z# |0 n/ y$ u0 x
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56
$ y2 ~' L$ o4 Z7 p/ @/ s8 P: r
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
/ Z3 a2 E! D9 B1 ^4 A
5 s, b4 }# q" y" Q
1 O6 i. l& _' C
  软件及时生成柱状图,如下图
' s+ H$ [8 y( r

( T) y5 k0 d/ {/ o% a
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
# U0 o) O* p3 t: x  ~- t0 e4 q
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

7 I. s; Q$ A$ w% t1 S4 ]
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93
" {+ q1 L% Z  @* P
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
" r! l% u+ O/ O

% c( |$ ~2 ~+ {; p. X) }

$ Q8 d1 [$ U! q& o' p
在data栏中输入数据

0 `7 O; B5 ^/ q
( Y$ k% v2 s# n4 T' T; ^
! q8 C7 d8 X4 K: f* ?; x
软件即时生成的图如下图
* S% d+ [; r( M; W" [7 \; }" _
  ?/ R$ x: a2 c- `! G' ]3 I) Q

9 f  I4 y" L( ~; K
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

; k9 h# ^! L( f* b/ M: k; r
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
; _( W+ p" Z& W+ L3 y- ^
3. 组合和导出图片
  M# F0 `& h6 H6 A
点击layout栏,出现下图所示界面
8 \1 W5 G  M6 S' \
1 G! T4 o7 ~# w0 ]6 r

2 w2 c8 Z& n' b: n

0 k1 m" j+ A1 x% ?$ V
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
, c. \$ R2 |  {  E) W9 m0 \

( m! l. ?, I' K7 J' |

& o% W6 o4 s/ T0 x9 V
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
' t5 ^* y! E  r
! d* W3 L# K0 b  j

( W& Y1 [7 d5 n
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
; y8 L) I. y. ]
/ u$ q- b& v, o& H: v* I# H
0 F7 x2 x% U' y- L
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
- p+ A9 x, S! z& M6 I. `. a5 d

5 T, Z; a7 b5 b1 U4 t0 ^
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
1 t7 q' c8 p' j- i满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
3 d, g/ Y, l( G1 d) [' J
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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