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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
% R, P; O$ T1 V) Y) G' |4 \2 W7 v
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?

5 t% [3 c7 l8 D5 {: F
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
7 ?* i) ~0 I2 A. U0 M
——正式开始——
8 h7 p1 Z: Z0 |: ^5 C
1. 折线图

9 q2 |! m1 D' H8 @' {6 O
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

8 j9 m6 G3 m( d. i
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
/ [4 o$ o* V4 S2 n; Y# g# r
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
/ @; ?6 e! `, r; {
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:
# {- I& @( S( N. n, D% X
2 P( h5 M4 Y7 z7 ]9 d; x

* V9 r9 B5 a. O, O1 R" P
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图

& F  w0 U; X! Q+ G+ {# k" F
8 d7 h: f5 V# ]1 h( l

$ x+ S0 Z6 r' B, N, L8 T5 L
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
% @8 q( b; h, W/ @; ^
( [6 ]* p6 t* g
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
, S% y- i. u8 r

7 c1 N$ G% t7 j" Y; U- i

' x' u& d8 r5 f* b
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图

$ D9 _3 p  m2 \

) f* E) d. L$ n/ ~2 c( X# b
' m( H; s# S  b0 g) N+ f8 j
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

" Y1 m( N1 E4 H) }4 z# N
0 t9 m& @/ f8 h3 S  u# W& [% N* K1 M
1 M" d3 y& Z3 N
  在Data栏中输入数据
" h; Q; @/ g$ H2 f; y# s2 C
. Q3 H+ @0 a/ G3 `
2 I' J' U, D  {' B0 e
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
" z: m* i' R3 p2 u' d# d

9 E- _  G2 ~4 t9 @. Y3 E
5 G5 o7 e6 r+ b5 j, ^" L
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

& a8 B) K1 ^: X2 ]1 j
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图

2 J. q0 A& Z$ t4 Q* q+ _0 Q- ~. i, X
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
& _) r+ L# w/ D) K
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
# _, C/ U& N4 f7 j
7 D$ S4 G! C3 E  w- F- a: ]" m
7 T: z  W% f. U" g1 g1 O1 z/ ?+ X
在data栏中粘贴数据,如下图
2 s. E6 f  `( f. A" i
  w: q  a9 b0 _. F! M" h

$ H/ W2 P" z( V' P
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. B% v% m- v+ A
; d0 a9 |( w. L# a' r5 A
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
! c* Z! K' Z6 s5 Y" g% Q/ @
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
: ?& i' y5 c: N) W2 F
& t( y: d9 `' j8 S  S2 _

! A# Z* N  p5 r" @, h4 |) a
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
- G6 O# B; N/ p4 c
8 \0 n0 s& i% }* z

4 W1 T6 Q" Y/ s+ q; i% ~
  将数据粘贴进去
$ J9 D; {: b* ]7 V& r  \9 v1 ?+ K% j

; L- P3 o( K3 ~1 }

  D2 c9 {3 A+ V" [
  软件即时生成的图如下图所示:

+ B6 ?" H- @1 Z/ X7 A% S

3 _% Q, R8 a2 u6 G# X

5 h2 p% c# }8 X$ h
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

! b. q& d, j$ n) G* k: ^
2. 柱状图

* i5 L8 e# Y/ C- Y
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
! c$ y( B# Q; ]# G! S
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

1 O9 d4 O% L+ a3 S- U/ }
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
1 b' W6 k# s: B' H( g
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

* C  S6 U1 ?5 u- w7 T3 B9 ^8 q/ q
8 D3 ~$ \& N; N1 ?, V9 u
- t, ~0 K: ]6 G# z( }
在Data分栏中输入以下数据
* _0 {5 p' x4 C! P  ]

( `1 V! w% c- ?/ q; M2 ]$ y

/ H/ C8 k. {) x) A- W) e
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

# m, u' L! w$ }' N! A% o
: x( c8 j# N" v, ~6 r
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

" b$ O; _& w% g4 b, d7 t/ d. L
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
$ p- Y& g# Q2 \# T1 L7 F
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
9 \. d. H0 |% {. a8 A: o/ b- ~

. e( ~% t9 ^' @8 K! R
! u, Z2 e8 X0 t- z/ a
  在Data分栏中输入以下数据

7 f, ~9 C# A5 p3 `1 r+ s2 D

9 G' L6 z, S8 v0 S! n: X* |$ m
6 j% J3 p* ?  ~( E  M
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
6 d( j& n4 T9 L; L( x% w, ?& U$ h

3 I( y7 [4 \: ~1 I. v, ]
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图

- a6 G8 V' ~. p6 Z/ u
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

' ?) w9 i- m1 i  ]4 j. E
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
. q6 J4 F" \4 B$ `
& a1 E1 D! }% D6 i7 i# r  k* e5 T
( t8 v4 a" n! v& I) ]4 ?; n
  软件及时生成柱状图,如下图

! `( x% m; @' V

$ W* Y/ D% Y  X7 c/ }& W! [2 R
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图

; ^- ?  A/ p. R# w" g2 e
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

' I; R, N' W# O3 }* o
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

* g' B* u/ U8 y6 ]2 _0 ?# t
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
$ r$ \0 G& {- I  [
: E9 @' |3 G6 v

& ]. S$ i' h. ]  N! k
在data栏中输入数据

9 q! _* b, L* X4 w
6 ~) b* c! i7 [+ |& w6 y3 V+ l: \/ c

/ h$ c  ]; J4 M1 c
软件即时生成的图如下图

5 B3 y1 o6 f! c3 D! [  b4 ]
% l' t9 j" I) k

  Q/ Z7 p8 N4 n! B+ g5 n, u& G
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
6 J+ J+ C6 Q$ F) Z% R, g0 ^  J; h+ q
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

  ^  r) c% E0 x! [2 O; H
3. 组合和导出图片
6 k: H+ u% P8 c
点击layout栏,出现下图所示界面

% P, }* [  C+ U* [# ~# [
  p7 I, e' X" I  Q* m* M) K
0 @* `" Q3 V: s# {) I% M
  b' S" V# m; ^! Q; [4 [+ {5 a* F
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
/ L! C" N  W( y& h9 w8 r2 A$ y

8 y- ~/ M) j( n) ?  C

1 R8 q6 a# X9 {. o3 u2 r4 E3 h2 L
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

, ]0 a. ~+ G& E1 t+ c' @. A

) X3 {; q4 w# h9 \2 H7 p
) ^* S; y$ [  V' q0 M" p
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图
7 e: M2 L% H4 v( j8 r  d
- H5 T6 b  G; R0 l! U

2 S# f6 \& P& a' Q+ |
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图

! n2 e9 W. I) n( N( _
4 f1 }" x5 S$ w9 ?' [
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!1 {. p7 h  ^) [( p8 i6 k, L

, N' A. q: f0 ?' t* Z; S
8 B; C5 C0 b3 k4 ~比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
; _* n# i6 E8 D7 W' b0 w满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!
  p2 ?1 X* F0 i& h0 E, B% |7 r* `
刚好微信圈有这个,就转过来了。

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发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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