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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术

3 B2 F5 H$ m  L& Q8 ]0 _
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
6 O0 i4 q) s, u0 H. a' ^: e1 w
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
2 _' X  U$ u; R% p4 b0 y  [7 A7 ?
——正式开始——

+ a1 N" b3 }% w
1. 折线图
1 X0 N( v! p: S/ n7 c
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。
% Q( Y7 @2 b: Q; Q4 \) Y4 ?
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
, r8 S6 v8 v6 [8 R5 S/ Z) V! N) S0 P
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196

, H" `5 L& `# ^
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

1 `: C7 b3 ^9 A
$ r  |- `' T" Q  Y( x

' K  w( I4 V1 j6 T
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
6 ~& c1 P7 R4 b" w0 ~1 D% L0 W4 G
2 n: O' t! p7 |$ w& u: }& x
" ?* |: ^( A7 M1 `
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?
8 V/ g! i3 q( \/ i( \& c1 n

; {! V1 \: t9 f7 S. s/ l
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图

9 N" u& I0 F# r# K
3 Z) j( ~6 y  Y# r$ X+ b

2 t9 z; v! g. |( V& V
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
1 ^1 n" h, t' {& Q9 p- s9 E& E
: o6 y1 P% q# {# Q

& u* R- v0 D6 S
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4

' I& P* ?/ q; F) N* [  T
  R3 [& A+ B& J9 I( r
, A9 Y% n& [* O: G5 v: U
  在Data栏中输入数据
6 o! {" w7 p7 U2 Z

% ?- [: z: _) H, m

& O! L! H! T" D, G
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
6 H/ p% e# u& d; H* d
) x2 Y4 Q- L1 M7 {1 W+ a# J$ F

( e/ K) V( X5 ~# \; B; V
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图
$ P, W3 D  s% Y6 Q
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
- c+ i9 h, t8 v; K  U8 |$ Z2 u! B- e
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56
7 e! O$ f( [6 L1 ?
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图

1 S' H! g8 ?/ j4 k7 \
. r. ^4 M, r$ X( l; F& k
. j# ~3 [, d/ k( g
在data栏中粘贴数据,如下图
# _( _! R: }7 g5 `& z" o

9 e' U7 o- W1 `4 |
3 v' Z5 E# f' R
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:
. h+ ]$ L8 b- t0 |  s
' O' b9 K# u4 [3 @! V5 q
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图

0 R) s; {* J3 v: Y# J; g- U/ j1 L
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。
8 S4 _2 j4 b- i
/ j7 B2 y0 E- k0 `7 r; ^! O
4 P! t+ a3 u& e# P6 c7 ?$ p
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
5 w5 {: D+ q) Z, m4 E# O
( Z4 e* d/ Q3 y( }

, I" N8 t- p8 [# y
  将数据粘贴进去
! h3 P4 h, ]# P9 _# O3 m8 p7 Q3 }- V7 i
. A4 ]2 x9 b& V, E7 K9 b

' n' _  }2 R( U0 a0 i5 _
  软件即时生成的图如下图所示:

/ o3 i1 u; V! K+ ~, N

! A# Y; V* p' y2 \9 |

6 K6 t4 M" l* H! U
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

1 J4 r# v2 G1 i: K" F0 x
2. 柱状图
# m3 j2 q0 t2 H* {9 t
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
; z) `+ H" a1 W, r, D3 C* v) `
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图

, c, _) w5 K$ ?
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483
! }6 K! B, K: Z
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

* z5 t' v  I& Y8 Z0 Z/ A4 ?( G8 Q
+ \" ?* |0 Q1 j

6 S1 z7 P/ }6 ^/ O3 O! f9 y
在Data分栏中输入以下数据

% s" ~- F3 f2 f, ]$ i
2 p" u: T& F' R  [& C
) W+ g7 E; N6 g! A! g9 n1 T
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:
4 ^9 k- W, Y0 U, l# y1 `
" h% n, d9 p6 H8 P% {# K+ V
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图
, z# S6 L) b; u: \+ k( ^' a
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196
! x/ q8 \5 i, \) J( l% O7 N2 R
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:

& o) s5 H+ G9 y
  m/ Y; n5 Z9 D: ^3 X: E3 b  e" G3 m
+ S, H$ x7 a7 Q; M3 L# K
  在Data分栏中输入以下数据
( D: V9 O+ I% o% C3 r

2 g4 {" H7 q: N3 U: y  \* a
" x' l) }( N& t( V* \- F
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。
9 P' L/ I% d9 ]
% {* \" n! r; p2 S
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
9 I" P) o) X0 }0 p+ }) F
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

& a4 |9 a: E) _8 O
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

: K% P( W3 \; k; F; D/ Z+ `% D

; f' ]. q$ J1 F* R( n( }) N- i% z

3 o; O$ F" o: ~2 Q. |
  软件及时生成柱状图,如下图
" r+ h/ @) A9 Y  r8 q

* r7 B% `  N, l6 j
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
/ t  [6 a& ?" _; s9 T% j
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

$ k4 W+ \& c6 Q1 W
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

. A1 i) {( `0 s6 Y) s
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图

& w4 |; U9 C2 B0 T9 V: W

  \, l/ o1 w' I; D' }0 S7 {# }
$ C: J, \" E8 o6 _+ T2 u
在data栏中输入数据

& S. m: L0 @9 d. X; d. C
  R# J: x" C; S% X, U4 Q
2 i; N0 E7 f5 R& k* N
软件即时生成的图如下图
/ b2 p, s& r# m( W$ |

. g, [# [6 B6 u8 b/ ?

) K, l$ l, B. @5 p
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:
  M8 [0 N% |4 x
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。
8 s/ ]$ \* e. I. z% A5 Y: d
3. 组合和导出图片

4 W1 k" z+ V! ^( R$ E  ]2 m. Q
点击layout栏,出现下图所示界面

$ R4 v$ p$ n$ S+ O  Z3 A4 _

3 [2 V% g$ V& `* W) x! Y5 z

/ J7 \% h6 v+ Y; j
% K' m2 J  [3 `
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列
9 A! T  X; f+ b# B

2 i$ t" Y. {" i& k
' v) ]4 R( y6 l2 u0 ~4 H
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示
3 ~& f; f" ~8 d. Y% E

+ o  p: s# b! n( e% U
0 l1 W$ `) D2 T9 m# Z2 @& J: o1 }$ F/ G
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

* U# p. I. Y. V1 r" q+ _

/ ?' o* Q. `/ c9 x7 a
7 M3 l( q! B. p
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
0 M# a: v2 L$ s/ B" i7 f) v( l
, Z/ W7 P1 }# {/ c) ^
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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论坛元老

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!* i$ G) n0 i. V5 T2 `
3 L+ O+ O2 d" `( I' L5 @3 H: [, x! B
( A4 q0 H3 {+ T! @# F) D# P$ n) w
比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12; G) d$ d- H, i( ]! U3 U
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

, C: M8 t# T0 n$ f, L( R" |刚好微信圈有这个,就转过来了。

9

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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