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如何用Graphpad Prism5快速做出符合SCI投稿要求的统计图

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论坛元老

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楼主
发表于 2015-5-13 08:52:28 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
来源:医学生学术
& {$ W! t/ h: d
  您还在为做统计图头痛不已吗?还在一边抱怨excel怎么这么笨却又不想从零开始学习那些复杂的统计作图软件吗?有没有什么解决的办法呢?
$ V9 E6 i# y1 Q6 B% h7 F# }
  小编发现GraphPad Prism不仅简单易学而且可以搞定大部分医学研究所需的统计与作图,所以今天总结了几种常用统计图的做法,教您轻松快速地做出漂亮的统计图,您只需花很少的时间看完这个教程就可以彻底摆脱excel笨拙的作图功能了。
& S) Y5 r+ b  x- Z
——正式开始——
' u+ _: b* N" C) [
1. 折线图
4 e7 @! n1 E  t* ~& f5 u  r
  折线图最为统计图中很常见的一类图,它的特点是可以显示随时间而变化的连续数据,因此每个数据点都有一个相应的X轴值和Y轴值,所以我们在用graphpad做折线图时在数据表类型的选择上一般选XY图(XY graphs)。如下文实例。

! A0 o, ~# s; D
1.1 根据Table1的1组原始数据(4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
1 b/ `  ]; H  z( W( ]# N
Time (days)
OA
0.
0.942
0.846
0.691
0.515
4.
0.717
0.836
0.653
0.483
24.
0.408
0.367
0.342
0.231
48.
0.451
0.409
0.335
0.196
: p5 I. K* n$ w) L
  打开Graphpad prism 5软件,选择XY图(XY graphs),折线图图标,因为是原始数据,需要软件帮你计算均值和误差,因此你要告诉软件你的Y值的样本数是多少,这边的样本数是4,因此我们把样本数设为4,如下图:

# n$ l) e2 d3 i: I" R
1 H3 J4 G1 Q4 {3 M6 z" n+ {4 m
9 \6 G5 {3 E) d
  在Data分栏中将数据粘贴进去,如下图
8 c# t0 Y* d* \' r

" h  V  ^8 H/ x6 ~1 I7 e
* Z) s" \8 ]9 E( h
  软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好折线图,把字体和坐标轴方向改成你想要的格式后,如下图一幅漂亮的折线图就做好了,简单吧?

4 e* R* l; n* T! l5 f% W

% m! D& s( `7 x, m. {5 g$ X
1.2 根据Table2的原始数据(治疗组和对照组的4个样本在4个时间点分别测得的OA值)做折线图
' _0 [' ^6 A. G2 F

( F- F# b/ m* C1 ^
: L- g) @. o  C4 |1 D! R
  打开insert 菜单的New Data Table功能,加入一张新的数据表,见下图
. E- S+ o% O8 H
( ^1 k" K& R+ R# R; {

# W8 m' C8 j) ~# n6 `3 s
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件样本数是4
9 A) i* `1 `" ?1 z
1 v9 T* s  f" e! z
6 Y, k  E" s4 f% }5 R
  在Data栏中输入数据
/ a& R0 k$ G- E) J1 \# ?, U
0 ?5 f; b' ]+ d% P. J* j

- L. J9 }1 j, B9 j1 k7 b" U
  软件已经自动帮你把图做好了,稍微美化后得下图:
( K6 `; K0 O7 |9 J0 u

* H# v7 f, ^- K# x1 k

* S8 K( S$ `7 I) V
1.3 用已经处理好的1组数据做折线图

& `3 _% j7 N6 f7 c) M4 t
  如果你的数据是用其他软件(excel,origin,etc..)已经处理过的,Graphpad prism也可以帮你完成剩下的作图工作,你只需告诉软件你输入的数据是已经计算好的就行了,比如你想用Table3的1组数据做折线图
, ]  ?" ~* b7 r% y- n5 i' W3 \2 \
Table3
Time (days)
OA
Mean
SD
0.
1.000
0.17
4.
1.725
0.21
24.
2.133
0.41
48.
1.859
0.56

+ y" ^) g! X$ e
新建一个数据表,仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图
' G% S  M& p! q1 @7 X
6 y2 W. g* C9 i4 k
0 m6 Z' U6 r) k. [8 D
在data栏中粘贴数据,如下图

3 X* h% ?2 V0 ^( _

6 O8 [( |7 u! W* L2 c
" S% b8 }8 |) B
  打开Graphs栏目下的Data3,看到软件已经做好了图,稍微调整一下字体的大小,就可以得出下图所示的折线图了:

8 I* k7 g( C4 Z5 o  Z2 \. [

" I" A3 H( r7 j. B
1.4 用已经处理好的2组数据做折线比较图
' n7 |4 |2 Y& \# O! S3 j
  如果要用Table4所示的两组已经处理好的数据作图,步骤和1.3的一样。

8 C* z4 b1 E6 R9 K1 R
6 \* Z% {9 P- s; f* s8 z( p
5 }: l5 ]. O5 ]. q8 X6 L+ J
  仍然选择XY图(XY graphs),告诉软件你输入的是计算好的值,见下图:
7 W9 j; ?  ^, u5 D% Y# ^+ u" c
3 Z, Q+ ^' Y9 B* j
! [2 }: ]* _& X+ t+ P, `
  将数据粘贴进去
0 a( ]' U4 _7 F+ {0 [
; H# ^( y" D* c5 Y0 N& B4 T3 y8 b

$ c1 _" C; o/ ?0 S  a7 Z8 b
  软件即时生成的图如下图所示:

: ]# Z$ f/ T5 q8 k7 x

3 ?' G. V3 x* S, q
/ t$ O# l, s# B4 e
折线图的处理讲完了,简单吧,让我们来看看柱状图怎么做

5 r% E0 \4 `9 b
2. 柱状图

' g: u' Y2 T9 P/ T9 ~) o% s) C
  柱状图可以很直观地表示出不同组别之间的数值差异,和折线图不同的一点是它的X轴对应的是组别而不是数值,因此在GraphPad分类栏的选择上也有所不同,见下文的实例
4 \% X' @# Z% D2 [3 a6 H
2.1根据Table 5的原始数据做柱状图
" G. Y' M$ g9 F% v
Table 5
Control A
Control B
Sample1
0.942
0.717
Sample2
0.846
0.836
Sample3
0.691
0.653
Sample4
0.515
0.483

3 q* k4 p, E) c7 b, F6 o
  选择Column graphs栏,因为该栏默认输入的都是原始数据,因此没有输入样本数的地方,只需选择数据处理类型为(Mean&SD), 如下图。

2 U. L$ A3 t$ l4 h
+ [. D. c# w/ G, v) ^8 U: Z

% u6 n9 A" Z* `" t+ q
在Data分栏中输入以下数据
. I+ |: Z7 y2 w9 U0 D
6 H% p, _5 p' _6 k+ }$ C2 d0 V0 P0 ?

! q: t2 N8 t- d8 j& m% Z; \1 t
软件就会自动帮你算出均值和误差值,并做好柱状图,见下图:

) Q  H% L. e- \

: j6 s( \8 }/ o- a# r5 t
2.2 根据Table6的原始数据做两组数据比较的柱状图

- ?* V6 b0 Z+ k2 o# \6 @
Table 6
Group A
Group B
Control
0.942
0.846
0.691
0.515
,
0.717
0.836
0.653
0.483
Treated
0.408
0.367
0.342
0.231
0.451
0.409
0.335
0.196

; B- v+ w& Q9 w( Q
  这次因为涉及到两组数据比较,所以我们选择grouped栏,图表类型选择柱状图,因为Grouped栏并不是像Column graphs栏一样默认输入的是原始数据,因此有输入样本数的地方,这边的样本数是4,因此我们相应地设置样本为4,见下图:
3 f- F; }6 n, e

& M$ Y" d& D) O) A

( ]% H) W" _4 `  W+ H
  在Data分栏中输入以下数据

3 b# M- B% X: F2 L" z
+ j/ d/ p9 ?, k) x: A3 l
( {7 E0 y- X' j8 k
  软件会自动帮你做好一幅漂亮的分组柱状图,如下图。

! H. f6 ?; W6 A' O; ~

7 v' t5 H. r3 |1 i. z# w
2.3如果你的数据是已经处理过的数据也可以直接导入或拷贝到Graphpad,现在我们用Table7中的数据做一个柱状图
) L6 r# t6 N& x
Table 7
Control
Mean
SD
A
1.000
0.17
B
1.725
0.21
C
2.133
0.41
D
1.859
0.56

2 O& s- R5 i4 y% j1 c- n5 Y
  仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
: r. }" l( ?% W* v$ q

) ?$ G) ]" x7 x. A
0 H$ Z& s0 F9 T& J! H5 [
  软件及时生成柱状图,如下图
3 N6 k8 v+ A& r1 \6 A( V

# X/ l5 \  {$ \7 N! ~
2.4 用两组计算好的数据做一个两组比较的柱状图
; m% C& o/ V% w3 _
用Table 8的数据做成两组比较的柱状图

6 p  d7 h$ s3 D, c" U' B
Control
Treated
A
1.000
0.17
3.604
0.31
B
1.725
0.21
2.534
0.43
C
2.133
0.41
3.381
0.74
D
1.859
0.56
3.913
0.93

+ h2 X1 Z/ }: t* E8 y$ P
  操作步骤和2.3一样,只需多输入一组数据,仍然选择Grouped栏,告诉软件你输入的值是已经计算好的,如下图
; \. D( E8 t$ g" ]  R/ `

4 F. c2 V+ g" o/ i

. E0 F' z, n+ E# f- U) w2 s4 T7 j
在data栏中输入数据

) `3 e/ k5 X8 Q% {, }" ?# A

; d' I: ?% E" }
7 s7 N% k  E' E- e: j* G
软件即时生成的图如下图
4 z# Q5 o0 ]+ M) w, l, h6 c- d
* Z3 d% Y2 {5 t: R5 X

; @3 U& U& \- j6 T' C
折线图和柱状图的处理都讲完了,在graphpad数据表类型的选择上小编总结出了2条规律:

9 [2 v- X% b. E0 m, h9 ]/ e
一、折线图,散点图这种有一一对应的X,Y值一般都选择XY栏
二、柱状图,箱型图这种有组别的数据需要用软件计算的选择column栏,处理加工过的数据一般选择group栏。

1 [) Q- y5 V; v/ _
3. 组合和导出图片

- r  K9 D; R& I; R
点击layout栏,出现下图所示界面

' N! O. g6 f2 F/ I
  B" r! a& l+ b! D, D" g# b( l& j
7 Z, e) H! }& i: u0 i2 \
8 ~  k! S- ~/ l" t- S4 o9 t9 `
  根据你的图片的数量,选择合适的布局,下图选择的是6张图分成3排排列

3 r- [& z% ]1 i& O2 L8 u0 l

3 C2 H8 `3 R/ W2 A
/ Z8 Y- s( Z8 Z0 g3 t/ |  P5 f) W
  将做好的图片拖到对应的方格中,用添加文章工具加入图片编号,完成后如下图所示

# w3 d* z& P, D& H4 x& i
5 J) ~$ w( P) W  X: I. K0 y  [
+ b$ J1 V2 v2 T, I+ G& b6 X
  然后导出图片:点击File目录下的Export,出现下图所示的界面,选择好符合相关SCI杂志要求的格式,分辨率和宽度,如下图

% j" _) _- N% j6 i
3 k2 [4 H- t, l- ?$ m" K

- a" u9 f& Z% A) U! U5 f
  点击ok,一张漂亮的可以直接拿去投稿的组合图就做好了,见下图
: e7 l- I0 V; k: M6 W! H$ v% Q- a
7 N* e) J" U, F; H5 D; U
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沙发
 楼主| 发表于 2015-5-13 08:55:08 | 只看该作者
补充,对于样本量少于5的Groups图,不建议做柱状图,而应该做散点图。

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板凳
发表于 2015-5-13 09:12:24 | 只看该作者
满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!2 R/ v: f$ ]* D- M
2 n) S0 \; F0 {( G+ a$ O! m1 N4 R

. m7 H! D# f' g( l) y8 C比起SAS、SPSS来说,这个GraphPad Prism易学易用,建议微信号推广一下         

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论坛元老

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地板
 楼主| 发表于 2015-5-13 09:25:05 | 只看该作者
walkundersky 发表于 2015-5-13 09:12
% [5 }9 T, v! I6 W# s2 j7 {满清兄有心了,前几天刚聊到这个软件,就分享出教程了!

3 C) l7 v; F- S/ f1 y) ?0 J刚好微信圈有这个,就转过来了。

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病毒学院小学生

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5#
发表于 2015-5-13 17:01:15 | 只看该作者
很棒的软件啊!表示喜欢!
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